ECTS - University of Pisa
Il corso integrato ha l’obiettivo di consentire allo studente di conoscere e di comprendere nozioni di base e conoscenze scientifiche aggiornate riguardanti le caratteristiche tassonomiche, morfologiche, fisiologiche, genetiche, patogenetiche, epidemiologiche, immunologiche e farmacologiche di microrganismi e virus agenti eziologici di malattie da infezione nell’uomo. Ha inoltre l’obiettivo di fornire la capacità di valutazione, interpretazione e gestione degli approcci microbiologici e virologici per la diagnosi, la terapia e la profilassi delle infezioni del cavo orale e di controllo delle infezioni crociate in odontoiatria. Ha, infine, l’obiettivo di fornire agli studenti conoscenze relative ai metodi epidemiologici per la valutazione dei fenomeni sanitari e dei bisogni di salute, gli strumenti per la lettura e l’interpretazione di articoli scientifici. Fornire la conoscenza dei determinanti delle malattie trasmissibili e non trasmissibili, le modalità di prevenzione e le basi dell'organizzazione dei servizi sanitari.
Al termine del corso gli studenti avranno acquisito gli strumenti per utilizzare nell’esercizio della professione le conoscenze e la comprensione acquisite.
The student who successfully completes the course will be able to demonstrate advanced knowledge of the structural and physiologic characteristics of the microorganisms, with special regards to human pathogens, and the study of the mechanisms of the infectious diseases. In addition, aim of the course is to provide the students with a good knowledge of the mechanisms of action of the most common antibacterial and antiviral drugs and the modalities by which infectious agents develop resistance to them. The student will also have advanced knowledge of the primary risk factors and conditions that contribute to the development of chronic diseases. He/she will acquire the principles of infectious disease prevention and control in community or in healthcare facilities. In addition, the student will have knowledge on strategies for health promotion including the cultural, social and behavioral determinants of disease and epidemiological methods used in the study of communicable diseases.
L’accertamento del raggiungimento degli obiettivi previsti dal corso verrà effettuato mediante un esame orale. Non sono previste verifiche in itinere. Mediante domande riguardanti i contenuti del corso verrà accertato se lo studente ha raggiunto l’obiettivo della conoscenza e della comprensione della disciplina scientifica e se sia in grado di utilizzare in modo appropriato il linguaggio tecnico-scientifico e di applicare le conoscenze acquisite nell’esercizio della professione. L’accertata incapacità di rispondere ad una domanda o di dimostrare almeno una conoscenza elementare dell’argomento oggetto della domanda comporterà il non superamento dell’esame. In caso di superamento dell’esame, l’attribuzione del voto, espresso in trentesimi, sarà effettuata in base al grado di raggiungimento degli obiettivi.
The student will be assessed on his/her ability to discuss the main course contents using the appropriate terminology. During the oral exam, the student must be able to demonstrate his/her knowledge of the main topics of the course and the ability to discuss, with critical awareness, issues relative to infectious agents, epidemiology, pathogenesis, laboratory diagnosis of the infectious diseases, and measures to prevent them.
Methods:
Non applicabile
Non applicabile
Non applicabile
Non applicabile
Modulo di Igiene Generale ed Applicata
Avere superato il modulo di Statistica
Gli argomenti riguardanti il corso integrato verranno presentati e discussi mediante lezioni frontali con l'ausilio di materiale iconografico e bibliografico che, al termine del corso, saranno messi a disposizione degli studenti per le parti che serviranno ad integrare i testi adottati. Durante le lezioni saranno esposti i concetti principali di ogni argomento, sottolineando i collegamenti fra le varie parti del corso ed incentivando la partecipazione attiva degli studenti.
Delivery: face to face
Learning activities:
Attendance: Mandatory
Teaching methods:
ODONTOIATRIA E PROTESI DENTARIA
Programma MODULO DI MICROBIOLOGIA (vedi più sotto per il modulo di Igiene)
5 CFU, 50 0RE (1 CFU=10 ore)
Microbiologia generale
Introduzione al corso. La diversità del mondo microbico. Classificazione dei batteri. Caratteri morfologici, biochimici, sierologici, genetici. Struttura di una cellula batterica. Il citoplasma. La membrana citoplasmatica. La parete dei batteri Gram-positivi e Gram-negativi.
Il peptidoglicano: struttura e funzioni. Gli acidi teicoici e lipoteicoici: struttura e funzioni. La membrana esterna dei batteri Gram-negativi. Il lipopolisaccaride: struttura, funzioni, effetti biologici. Endotossine ed esotossine. Le proteine della membrana esterna.
La capsula batterica. I flagelli ed il movimento flagellare. La chemiotassi. I pili, le fibrie. La spora batterica: struttura, proprietà, processo di sporificazione, germinazione ed esocrescita. La nutrizione batterica. Produzione di energia nei batteri. Effetto dell'ossigeno sulla crescita microbica. Coltivazione dei batteri. Terreni liquidi e solidi.
La scissione binaria. Metodi di conta dei batteri: conta totale e conta vitale. Crescita dei batteri in coltura liquida: la curva di crescita batterica. Crescita dei batteri su una superficie: i biofilm microbici.
Cenni di genetica batterica.
I farmaci antimicrobici: definizioni e classificazione; meccanismi d'azione. La resistenza dei batteri ai farmaci.
Principi di diagnostica microbiologica: La raccolta del campione clinico. Siti di prelievo e tipi di campioni clinici. La diagnosi diretta di malattia infettiva tramite isolamento e coltura. La diagnosi diretta di malattia infettiva tramite rivelazione di macromolecole microbiche (metodi non colturali). La diagnosi indiretta o sierologica di malattia infettiva.
Microbiologia clinica
Genere Streptococcus: proprietà generali, classificazione, principali specie patogene. S. pyogenes: caratteristiche strutturali, fattori di virulenza e di patogenicità. Le malattie da S. pyogenes: suppurative e non suppurative. Cenni su altri streptococchi beta-emolitici. S. pneumoniae. Cenni sulla diagnosi di laboratorio delle infezioni streptococciche.
Genere Staphylococcus: proprietà generali. Specie di importanza medica. Coltivazione. Determinanti di patogenicità: componenti cellulari e secreti. Tossine stafilococciche. Principali quadri patologici dovuti alle proprietà invasive ed alla produzione di tossine; sindrome della cute scottata, sindrome dello shock tossico, intossicazione alimentare. Diagnosi di laboratorio. La farmaco resistenza di S. aureus.
Genere Clostridium; proprietà generali. Principali specie di importanza medica. Clostridium tetani ed il tetano; struttura e meccanismo di azione della tossina tetanica; patogenesi del tetano; misure di profilassi attiva e passiva.
Genere Neisseria: Neisseria meningitidis e la meningite cerebro-spinale-epidemica. Caratteristiche generali dei microrganismi appartenenti al genere Neisseria. Sierogruppi e sierotipi di Neisseria meningitidis. Fattori di virulenza. Epidemiologia. Immunità. Patogenesi della meningite. Vaccini. Diagnosi di laboratorio
Helicobacter pylori: Caratteristiche generali e scoperta. Epidemiologia delle infezioni da H. pylori. Possibili evoluzioni dell'infezione. Fattori di virulenza e di patogenicità. Fattori dell'ospite che influenzano le conseguenze dell'infezione. Cenni di diagnosi e terapia.
Microbiologia orale
L'ecosistema orale: habitat della cavità orale; le superfici mucose, le superfici dure, i fluidi orali; fattori ambientali che influiscono sulla crescita dei germi orali. Tappe di acquisizione della flora orale. La placca dentale come biofilm. Tappe della formazione della placca dentale. Interazioni microbiche nella placca dentale.
La carie ed i batteri cariogeni. Streptococchi orali: proprietà e classificazione. Streptococchi del gruppo mutans. Genere Lactobacillus. Genere Actinomyces. Patogenesi della carie. Fattori di virulenza dei batteri
Ezipatogenesi della malattia parodontale. Ecologia del solco gengivale in condizioni di salute e malattia. La natura infettiva delle malattie parodontali. Criteri da rispettare per definire una specie parodontopatogena. Meccanismi di danno tissutale. Fattori di virulenza.
Aggregatibacter actinomycetemcomitans: caratteri generali, fattori di virulenza; associazione con la parodontite giovanile localizzata. Porphyromonas gingivalis: caratteri generali; peculiarità strutturali; fattori di virulenza. Generalità su Tannerella forsythia, Prevotella intermedia e Treponema denticola. Fattori di rischio. Diagnosi di laboratorio (campioni clinici dal cavo orale, metodi diretti e metodi indiretti)
Infezioni dell’endodonto: genere Enterococcus
Micologia e parassitologia
I miceti o funghi: proprietà generali; struttura; replicazione. Le principali micosi di interesse medico. Cenni sui farmaci antifungini. I principali parassiti. Il ciclo della malaria.
Virologia generale e clinica
Struttura e replicazione dei virus:
Caratteristiche generali dei virus. Struttura e classificazione. Il capside, l'involucro, gli acidi nucleici virali. Fasi dell'infezione virale. Replicazione dei virus animali a DNA ed RNA. Infezioni virali litiche, persistenti, latenti, trasformanti, abortive.
I farmaci antivirali: bersagli di azione dei farmaci antivirali. Inibitori della fusione. Inibitori della scapsidazione. Inibitori della sintesi degli acidi nucleici virali. Inibitori delle proteasi. Inibitori del rilascio.
Generalità sui virus epatotropi:
Caratteri morfologici, vie di trasmissione, tipi di infezione. Epidemiologia delle epatiti virali in Italia.
Il virus dell'epatite A: Caratteristiche morfologiche ed antigeniche. Ciclo di replicazione. Vie di trasmissione. Patogenesi dell'infezione.
Il virus dell'epatite B e dell'epatite C: Caratteristiche morfologiche ed antigeniche. Ciclo di replicazione. Vie di trasmissione. Patogenesi dell'infezione e possibili evoluzioni. I principali marcatori sierici dell'infezione acuta e cronica. Vaccinazione e sieroprofilassi. Diagnosi di laboratorio
Retrovirus: Caratteristiche generali e classificazione. HIV: Caratteristiche morfologiche ed antigeniche. Ciclo di replicazione. Organizzazione del genoma virale e modalità di espressione dei geni. Proteine regolatorie e strutturali. Vie di trasmissione. Storia naturale dell'infezione da HIV attraverso il monitoraggio dei marcatori sierici. Infezioni opportunistiche in AIDS. Cenni di terapia antiretrovirale. Diagnosi di laboratorio.
Virus herpetici: Caratteristiche generali, classificazione, e ciclo di replicazione virale. Herpes simplex I e II, Virus di Epstein-Barr, Varicella-Zoster, Citomegalovirus, Herpes virus umani 6,7,8: vie di trasmissione, tipi di infezioni e meccanismi patogenetici.
Cenni su Picornavirus e Papilloma virus.
Il virus Sars-Cov-2: Caratteristiche generali, probabile origine, e ciclo di replicazione virale. Trasmissione. COVID-19. Vaccini e farmaci allo studio.
Programma del modulo di Igiene Generale ed Applicata
8 CFU, 80 0RE (1 CFU=10 ore)
Definizione di salute e sua evoluzione storica.
I determinanti di salute
Classificazione delle cause di malattia
Storia naturale delle malattie trasmissibili e cronico-degenerative.
Prevenzione: definizione e suddivisione in primaria, secondaria e terziaria.
Definizione e cenni storici di epidemiologia.
Classificazione degli approcci epidemiologici: Epidemiologia osservazionale e sperimentale, descrittiva ed analitica.
Demografia, i suoi principali indicatori: Natalità; Mortalità grezza, per causa e per età; Mortalità infantile
Le fonti dei dati. Dati disponibili; amministrativi, sanitari e di sorveglianza.
La documentazione clinica come fonte di dati epidemiologici
Disegni di studio:
Studi ecologici, serie storiche e case series.
Studi di prevalenza, caratteristiche e limiti
Studi di incidenza, caratteristiche e limiti
Studi retrospettivi caso controllo, caratteristiche e limiti
Indicatori di relazione causa effetto
Rischio relativo
Rischio attribuibile individuale e di popolazione
Odds Ratio
Criteri di causalità:
I postulati di Koch per le malattie trasmissibili
I criteri di Austin Bradford Hill per le malattie non trasmissibili.
La letteratura scientifica, criteri di interpretazione dei risultati.
Il test di screening, strumento di sanità pubblica: sensibilità, specificità valore predittivo positivo e negativo.
Modalità di trasmissione delle infezioni
Epidemiologia delle malattie trasmissibili
Prevenzione primaria delle malattie trasmissibili: la vaccinazione
Infezioni correlate all'assistenza
Disinfezione e sterilizzazione
Epidemiologia delle malattie non trasmissibili;
malattie cardiovascolari
malattie metaboliche
Storia ed organizzazione del SSN
Il finanziamento delle prestazioni sanitarie: FSN, FSR e i DRG
Competenze delle Regioni nell'organizzazione dei servizi sanitari: i LEA.
Microbiology:
The first part of the course deals with the classification criteria, morphology and physiology of various medically important infectious agents and understanding host-parasite interactions. The second part of the course focuses on the virulence factors of infectious agents (i.e. bacteria, virus, fungi) and how they cause diseases. The course will also provide the principles of laboratory diagnosis, prevention and therapy of important infectious diseases (e.g. tuberculosis, meningitis, AIDS, etc)
Hygiene:
The course deals with general organization of the Health System in Italy and its structures and responsibility at local, regional and national levels, with general determinants of health and means to quantify health in populations. The more specific aspects of hygiene from infective and chronic-degenerative disease epidemiology to the measures to reduce disease burden in populations, with an attention to disinfection/sterilization and vaccination will be dealt with.
Program MICROBIOLOGY MODULE
General microbiology
Introduction to the course. The diversity of the microbial world. Classification of bacteria. Morphological, biochemical, serological, genetic characters. Structure of a bacterial cell. The cytoplasm. The cytoplasmic membrane. The wall of Gram-positive and Gram-negative bacteria. The peptidoglycan: structure and functions. Theic and lipoteic acids: structure and functions. The outer membrane of Gram-negative bacteria. The lipopolysaccharide: structure, functions, biological effects. Endotoxins and exotoxins. The proteins of the outer membrane. The bacterial capsule. The flagella and the flagellar movement. Chemotaxis. The pili, the fibers. The bacterial spore: structure, properties, sporification process, germination and growth. Bacterial nutrition. Energy production in bacteria. Effect of oxygen on microbial growth. Cultivation of bacteria. Liquid and solid media. The binary split. Methods of counting bacteria: total count and vital count. Growth of bacteria in liquid culture: the bacterial growth curve. Growth of bacteria on a surface: microbial biofilms. Basics of bacterial genetics. Antimicrobial drugs: definitions and classification; mechanisms of action. The resistance of bacteria to drugs. Principles of microbiological diagnostics: The collection of the clinical sample. Collection sites and types of clinical specimens. Direct diagnosis of infectious disease by isolation and culture. Direct diagnosis of infectious disease through the detection of microbial macromolecules (non-culture methods). The indirect or serological diagnosis of infectious disease.
Clinical microbiology Genus Streptococcus: general properties, classification, main pathogenic species. S. pyogenes: structural characteristics, virulence and pathogenicity factors. S. pyogenes diseases: suppurative and non-suppurative. Notes on other beta-haemolytic streptococci. S. pneumoniae. Notes on the laboratory diagnosis of streptococcal infections. Staphylococcus genus: general properties. Species of medical importance. Cultivation. Determinants of pathogenicity: cellular and secreted components. Staphylococcal toxins. Main pathological pictures due to invasive properties and toxin production; scalded skin syndrome, toxic shock syndrome, food poisoning. Laboratory diagnosis. The drug resistance of S. aureus. Genus Clostridium; general properties. Main species of medical importance. Clostridium tetani and tetanus; structure and mechanism of action of the tetanus toxin; pathogenesis of tetanus; active and passive prophylaxis measures. Genus Neisseria: Neisseria meningitidis and cerebro-spinal-epidemic meningitis. General characteristics of microorganisms belonging to the genus Neisseria. Neisseria meningitidis serogroups and serotypes. Virulence factors. Epidemiology. Immunity. Pathogenesis of meningitis. Vaccines. Laboratory diagnosis Helicobacter pylori: General characteristics and discovery. Epidemiology of H. pylori infections. Possible evolutions of the infection. Virulence and pathogenicity factors. Host factors influencing the consequences of infection. Outline of diagnosis and therapy.
Oral microbiology The oral ecosystem: habitat of the oral cavity; mucous surfaces, hard surfaces, oral fluids; environmental factors that affect the growth of oral germs. Stages of acquisition of the oral flora. Dental plaque as a biofilm. Stages of dental plaque formation. Microbial interactions in dental plaque. Caries and cariogenic bacteria. Oral streptococci: properties and classification. Streptococci of the mutans group. Genus Lactobacillus. Genus Actinomyces. Pathogenesis of caries. Virulence factors of bacteria Ezipatogenesis of periodontal disease. Gingival sulcus ecology in health and disease conditions. The infectious nature of periodontal diseases. Criteria to be respected to define a periodontal pathogenic species. Mechanisms of tissue damage. Virulence factors. Aggregatibacter actinomycetemcomitans: general characters, virulence factors; association with localized juvenile periodontitis. Porphyromonas gingivalis: general characters; structural peculiarities; virulence factors. General information on Tannerella forsythia, Prevotella intermedia and Treponema denticola. Risk factors. Laboratory diagnosis (clinical samples from the oral cavity, direct methods and indirect methods) Infections of the endodontium: genus Enterococcus
Mycology and parasitology Fungi or fungi: general properties; structure; replication. The main mycoses of medical interest. Notes on antifungal drugs. The main parasites. The cycle of malaria.
General and clinical virology Virus structure and replication: General characteristics of viruses. Structure and classification. The capsid, the envelope, the viral nucleic acids. Stages of viral infection. Replication of animal DNA and RNA viruses. Viral lytic, persistent, latent, transforming, abortive infections. Antiviral drugs: targets of action of antiviral drugs. Fusion inhibitors. Inhibitors of scapsidation. Inhibitors of viral nucleic acid synthesis. Protease inhibitors. Release inhibitors. 2h General information on hepatotropic viruses: Morphological characters, transmission routes, types of infection. Epidemiology of viral hepatitis in Italy. The hepatitis A virus: morphological and antigenic characteristics. Replication cycle. Routes of transmission. Pathogenesis of infection. The hepatitis B and C viruses: morphological and antigenic characteristics. Replication cycle. Routes of transmission. Pathogenesis of the infection and possible evolution. The main serum markers of acute and chronic infection. Vaccination and seroprophylaxis. Laboratory diagnosis Retrovirus: General characteristics and classification. HIV: Morphological and antigenic characteristics. Replication cycle. Organization of the viral genome and mode of expression of genes. Structural and regulatory proteins. Routes of transmission. Natural history of HIV infection through monitoring of serum markers. Opportunistic Infections in AIDS. Basics of antiretroviral therapy. Laboratory diagnosis. Herpetic viruses: general characteristics, classification, and viral replication cycle. Herpes simplex I and II, Epstein-Barr virus, Varicella-Zoster, Cytomegalovirus, Human herpes virus 6,7,8: transmission routes, types of infections and pathogenetic mechanisms. Notes on Picornavirus and Papilloma virus. The Sars-Cov-2 virus: general characteristics, probable origin, and viral replication cycle. Transmission. COVID-19. Vaccines and drugs under study.
Program of the GENERAL AND APPLIED HYGIENE MODULE • Definition of health and its historical evolution. • The determinants of health • Classification of the causes of disease • Natural history of communicable and chronic-degenerative diseases. • Prevention: definition and subdivision into primary, secondary and tertiary. • Definition and historical notes of epidemiology. • Classification of epidemiological approaches: Observational and experimental, descriptive and analytical epidemiology. • Demography, its main indicators: Birth rate; Crude mortality, by cause and by age; Child mortality • The sources of the data. Available data; administrative, health and surveillance. • Clinical documentation as a source of epidemiological data • Study drawings: o Ecological studies, time series and case series. o Prevalence studies, characteristics and limits o Studies of incidence, characteristics and limits o Retrospective case control studies, characteristics and limits • Cause and effect relationship indicators o Relative risk o Individual and population attributable risk o Odds Ratio • Causality criteria: o Koch's postulates for communicable diseases o The Austin Bradford Hill Criteria for Noncommunicable Diseases. • The scientific literature, criteria for interpreting the results. • The screening test, a public health tool: sensitivity, specificity positive and negative predictive value. • Mode of transmission of infections • Epidemiology of communicable diseases • Primary prevention of communicable diseases: vaccination • Healthcare-related infections • Disinfection and sterilization • Epidemiology of non-communicable diseases; or cardiovascular disease or metabolic diseases • History and organization of the NHS o Financing of healthcare services: FSN, FSR and DRGs o Competence of the Regions in the organization of health services: the LEA. • Definition of health and its historical evolution. • The determinants of health • Classification of the causes of disease • Natural history of communicable and chronic-degenerative diseases. • Prevention: definition and subdivision into primary, secondary and tertiary. • Definition and historical notes of epidemiology. • Classification of epidemiological approaches: Observational and experimental, descriptive and analytical epidemiology. • Demography, its main indicators: Birth rate; Crude mortality, by cause and by age; Child mortality • The sources of the data. Available data; administrative, health and surveillance. • Clinical documentation as a source of epidemiological data • Study drawings: o Ecological studies, time series and case series. o Prevalence studies, characteristics and limits o Studies of incidence, characteristics and limits o Retrospective case control studies, characteristics and limits • Cause and effect relationship indicators o Relative risk o Individual and population attributable risk o Odds Ratio • Causality criteria: o Koch's postulates for communicable diseases o The Austin Bradford Hill Criteria for Noncommunicable Diseases. • The scientific literature, criteria for interpreting the results. • The screening test, a public health tool: sensitivity, specificity positive and negative predictive value. • Mode of transmission of infections • Epidemiology of communicable diseases • Primary prevention of communicable diseases: vaccination • Healthcare-related infections • Disinfection and sterilization • Epidemiology of non-communicable diseases; or cardiovascular disease or metabolic diseases • History and organization of the NHS o Financing of healthcare services: FSN, FSR and DRGs o Competence of the Regions in the organization of health services: the LEA.
Modulo di Microbiologia
TESTI DI RIFERIMENTO:
DIAPOSITIVE PRESENTATE A LEZIONE. Articoli di approfondimento suggeriti dal docente
Modulo di Igiene Generale ed Applicata
Signorelli C. Igiene e sanità pubblica. Società Editrice Universo, 2017.
Montagna M, Castiglia P, Liguori G, Quarto M. Igiene in Odontoiatria. Monduzzi Editore, 2004.
Durante il corso verranno indicate dal docente fonti di approfondimento.
Microbiology module REFERENCE TEXTS:
• Principles of MEDICAL MICROBIOLOGY, Guido Antonelli, Massimo Clementi, Gianni Pozzi, Gian Maria Rossolini, AMBROSIANA PUBLISHING HOUSE.
• THE BASES OF MICROBIOLOGY, with clinical insights, Richard A. Harvey, Pamela C. Champe, Bruce D. Fisher, ZANICHELLI
SLIDES PRESENTED IN LESSON. In-depth articles suggested by the teacher
General and Applied Hygiene Module
Signorelli C. Hygiene and public health. Universe Publishing Company, 2017.
Montagna M, Castiglia P, Liguori G, Quarto M. Hygiene in Dentistry. Monduzzi Editore, 2004.
During the course, sources for further information will be indicated by the teacher.
La frequenza al corso è obbligatoria.
Orale contestuale per i due moduli.
Contextual oral for the two modules.
