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MICROBIOLOGY AND VIROLOGY
ANTONELLA LUPETTI
Academic year2022/23
CourseBIOMEDICAL LABORATORY TECHNIQUES
Code227FF
Credits6
PeriodSemester 1
LanguageItalian

ModulesAreaTypeHoursTeacher(s)
METODOLOGIE E TECNICHE ANALITICHE IN MICROBIOLOGIAMED/46LEZIONI24
ANTONELLA LUPETTI unimap
METODOLOGIE E TECNICHE ANALITICHE IN VIROLOGIAMED/46LEZIONI24
MAURO PISTELLO unimap
Obiettivi di apprendimento
Learning outcomes
Conoscenze

Fornire le basi metodologiche delle tecniche diagnostiche microbiologiche e virologiche convenzionali e molecolari per la loro applicazione in tutti i settori dell’infettivologia.

Fornire le basi per la comprensione di metodiche colturali tradizionali, e per la comprensione delle nuove tecnologie diagnostiche già consolidate ed emergenti.

Conoscenza ed applicazione dei principi di biosicurezza nel laboratorio di microbiologia e virologia.

Knowledge

Provide the methodological bases of conventional and molecular microbiological and virological diagnostic techniques for their application in all sectors of infectious disease.

To provide the basis for understanding traditional cultivation methods, and for understanding already established and emerging new diagnostic technologies.

Knowledge and application of biosafety principles in the microbiology and virology laboratory.

Modalità di verifica delle conoscenze

Esame orale.

Assessment criteria of knowledge

Oral examination.

Capacità

Durante i periodi di frequenza obbligatoria nei laboratori di microbiologia e virologia verranno effettuati tirocini professionalizzanti, nei quali gli studenti verranno seguiti nell'apprendimento delle varie metodiche.

Modalità di verifica delle capacità

Gli studenti saranno valutati sia durante il periodo di tirocinio professionalizzante che tramite esame orale teorico/pratico alla fine del tirocinio.

Comportamenti

Viene valutata l'affidabilità dello studente nel portare avanti i compiti assegnati.

Modalità di verifica dei comportamenti

Il tutor controlla l'operato dello studente.

Prerequisiti (conoscenze iniziali)

Microbiologia Generale e Microbiologia Clinica. Virologia Generale e Virologia Clinica.

Teaching methods

Delivery: face to face

Learning activities:

  • attending lectures
  • participation in seminar
  • participation in discussions
  • individual study
  • Laboratory work
  • Practical

Attendance: Mandatory

Teaching methods:

  • Lectures
  • Seminar
  • laboratory
Programma (contenuti dell'insegnamento)

Metodologie e Tecniche analitiche in Microbiologia

Flora microbica locale. Classificazione generale dei miceti. Fattori di virulenza di Candida albicans. Diagnosi dei lieviti e degli ifomiceti. Come trattare il materiale biologico per la diagnosi batteriologica. Tampone faringeo. Espettorato, test di valutazione della qualità dell'espettorato. Urinocoltura per la ricerca di germi comuni. Urinocoltura (primo mitto) e tampone uretrale per ricerca Clamidia. Coprocoltura. Emocoltura. Coltura del liquor. Identificazione microbica classica e MALDI-TOF. Esame sierologico. Diagnosi di sifilide. Strumentazione nel laboratorio di Microbiologia. Tipizzazione molecolare.

 

Metodologie e Tecniche analitiche in Virologia

  1.  Criteri di classificazione dei virus, struttura e replicazione, modalità invio campioni al laboratorio.
  2. Tecniche di diagnosi diretta di infezione virale: ricerca di antigeni (agglutinazione al lattice, test immunocromatografici, IF); tecniche di diagnosi indiretta (FC, agglutinazione, inibizione della emoagglutinazione, neutralizzazione, IF, EIA); immunoblot.
  3. Tecniche di isolamento su linee cellulari sensibili, titolazione di isolati virali. Tecniche diagnostiche di infezione da virus a DNA (Herpesvirus, Parvovirus).
  4. Tecniche diagnostiche di infezione da virus a DNA (Papillomavirus, Polyomavirus, Adenovirus). Infezione da HIV-1.
  5. Infezione da HIV: sierologia diagnostica e tecniche di biologia molecolare (carica virale e analisi di sequenza per tipizzazione e farmacoresistenza); virus responsabili di epatiti.
  6. Epatite A, B, C, E: ricerca anticorpi e antigeni. Nuovi sistemi di quantificazione degli acidi nucleici. Test di farmacoresistenza.
  7. Virus a RNA (Paramixovirus e Orthomixovirus): diagnosi di infezione da virus del morbillo, parotite, rosolia, RSV, virus parainfluenza e influenza.
  8. Infezioni da Picornavirus; Infezioni da virus emergenti (Dengue, Chikungunya, West Nile, Ebola, Zika, Coronavirus).

 

Syllabus

Methodologies and analytical techniques in Microbiology

Local microbial flora. General classification of fungi. Virulence factors of Candida albicans. Diagnosis of yeasts and ifomycetes. How to treat biological material for bacteriological diagnosis. Pharyngeal swab. Sputum, sputum quality assessment test. Urine culture for common germs. Urine culture (first mitto) and urethral swab for Chlamydia research. Coproculture. Blood culture. Liquor culture. Classical microbial identification and MALDI-TOF. Serological examination. Syphilis diagnosis. Instrumentation in the Microbiology laboratory. Molecular typing.


  Methodologies and analytical techniques in Virology

Virus classification criteria, structure and replication, how to send samples to the laboratory.
Techniques for direct diagnosis of viral infection: antigen research (latex agglutination, immunochromatographic tests, IF); indirect diagnosis techniques (CF, agglutination, inhibition of hemagglutination, neutralization, IF, EIA); immunoblot.
Isolation techniques on sensitive cell lines, titration of viral isolates. Diagnostic techniques for DNA virus infection (Herpesvirus, Parvovirus).
Diagnostic techniques for DNA virus infection (Papillomavirus, Polyomavirus, Adenovirus). HIV-1 infection.
HIV infection: diagnostic serology and molecular biology techniques (viral load and sequence analysis by typing and drug resistance); viruses responsible for hepatitis.
Hepatitis A, B, C, E: search for antibodies and antigens. New quantification systems for nucleic acids. Drug resistance test.
RNA viruses (Paramixovirus and Orthomixovirus): diagnosis of infection with measles virus, mumps, rubella, RSV, parainfluenza virus and flu.
Picornavirus infections; Emerging virus infections (Dengue, Chikungunya, West Nile, Ebola, Zika, Coronavirus).
 

Bibliografia e materiale didattico

Microbiologia Medica IV edizione (Antonelli, Clementi, Pozzi, Rossolini)

Microbiologia Clinica (Lanciotti)

Bibliography

Medical Microbiology (Antonelli, Clementi, Pozzi, Rossolini)

Clinical Microbiology (Lanciotti)

Modalità d'esame

Esame orale.

Assessment methods

Oral examination.

Updated: 01/12/2022 11:23