ECTS - University of Pisa
| Modules | Area | Type | Hours | Teacher(s) | |
| MICROBIOLOGIA GENERALE | MED/07 | LEZIONI | 42 |
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Le finalità principali del corso sono l'acquisizione della conoscenza:
The main purposes of the course are to acquire the knowledge of:
Elaborato scritto su argomenti del programma del corso, affrontati e discussi estesamente nel corso delle lezioni frontali.
Written exam on topics of the course program explained and discussed during the lessons.
Al termine del corso lo studente avrà la capacità di divulgare e/o presentare in una relazione scritta i comportamenti corretti da tenere per prevenire, curare e diagnosticare le principali malattie infettive che ancora oggi affliggono l'umanità. Saprà inoltre interpretare un antibiogramma e valutare in maniera critica un referto microbiologico.
At the end of the course, the student will have the ability to disclose and/or present in a written report the correct measures to be taken to prevent, diagnose, and cure the major infectious diseases that are still affecting humanity today. He will also be able to interpret an antibiogram and critically evaluate a microbiological analysis report.
Elaborato scritto su argomenti del programma del corso, affrontati e discussi estesamente nel corso delle lezioni frontali.
Written exam on topics of the course program explained and discussed during the lessons.
Lo studente potrà acquisire comportamenti corretti riguardo all'uso dei farmaci ad attività antimicrobica e sviluppare sensibilità verso problematiche legate al controllo, diffusione, patogenesi e diagnosi di laboratorio delle malattie infettive.
The student will be able to acquire knowledge regarding the appropiate use of antimicrobial drugs and develop ability to manage issues related to the control, diffusion, pathogenesis and laboratory diagnosis of infectious diseases.
Elaborato scritto su argomenti riguardanti le problematiche legate al controllo, diffusione, patogenesi e diagnosi di laboratorio delle malattie infettive.
Written report to evaluate knowledge acquired to manage issues on topics related to control, diffusion, pathogenesis and laboratory diagnosis of infectious diseases.
Si richiede la conoscenza di elementi di base di biochimica, biologia della cellula, anatomia umana e fisiologia.
Knowledge on basic elements of biochemistry, cell biology, human anatomy and physiology is required.
MICROBIOLOGIA GENERALE
Struttura e fisiologia batterica:
Caratteristiche generali della cellula batterica: differenze tra procarioti ed eucarioti. Classificazione e tassonomia batterica. I principali gruppi di batteri.
Morfologia della cellula batterica: Struttura generalizzata di una cellula batterica. Citoplasma batterico. Inclusioni citoplasmatiche. Organizzazione del genoma batterico. Membrana cellulare: struttura e funzioni. Parete: Struttura e funzioni del peptidoglicano nei batteri Gram+ e Gram-. Membrana esterna dei batteri Gram-. Struttura del lipopolisaccaride (o endotossina) ed effetti biologici. Capsula: composizione chimica, evidenziazione, rapporti con la virulenza batterica. Flagelli e pili: ruolo fisiologico e nella virulenza.
La spora batterica: Ciclo di crescita di un microrganismo sporigeno. Struttura e formazione della spora. Germinazione ed esocrescita. Termoresistenza.
Fisiologia batterica: Esigenze nutrizionali dei batteri. Classificazione dei batteri in rapporto alla richiesta dell'ossigeno per la crescita. Coltivazione dei microrganismi: terreni solidi, liquidi, selettivi, discriminativi. Coltura di arrichimento. Isolamento in coltura pura. Cenni sulla coltivazione dei microrganismi anaerobi. Curva di crescita in terreni liquidi. Metodi di conta dei batteri. Fattori che influenzano la presenza e la durata delle varie fasi di crescita.
Cenni di genetica batterica: l'organizzazione del genoma batterico; l'origine della variabilità genetica nei batteri; meccanismi di scambio di frammenti di DNA tra batteri.
Chemioterapici ed antibiotici:
Concetto di tossicità selettiva. Attività batteriostatica e battericida di un farmaco. Meccanismi di azione dei principali farmaci antimicrobici. Fattori di resistenza: resistenza cromosomica (mutazione) ed extracromosomica (plasmidica). Metodi di valutazione della suscettibilità dei batteri ai farmaci: in terreno solido (metodo di Kirby-Bauer) ed in terreno liquido.
Cenni di immunità anti-infettiva:
Generalità sulla risposta immune naturale e acquisita. Definizioni. Antigeni. Anticorpi. Struttura delle immunoglobuline (Ig), principali proprietà biochimiche e biologiche delle diverse classi di Ig. Risposta primaria e secondaria ad uno stimolo antigenico. Azione protettiva degli anticorpi nelle malattie batteriche e virali. Riconoscimento dell'antigene da parte dei linfociti T. Classi di linfociti T e loro partecipazione all'immunità antinfettiva.
I meccanismi di patogenicità batterica:
Definizione di contagio, infezione, malattia, patogenicità, virulenza. La flora normale. I patogeni opportunisti. Invasività batterica, produzione di tossine. Esotossine ed endotossine.
MICROBIOLOGIA CLINICA
Cocchi Gram positivi:
Stafilococchi e streptococchi: caratteristiche morfologiche e colturali. Tossine ed enzimi. Patogenesi delle infezioni sostenute da Staphylococcus aureus e Streptococcus pyogenes. Diagnosi di laboratorio. Principali test di identificazione nell'ambito dei cocchi Gram positivi.
Bacilli Gram positivi:
Clostridi: Generalità sui clostridi. Clostridium tetani, C. botulinum, C. perfringens, C. difficile. Patogenesi dell'infezione, le tossine, forme cliniche, tossinfezioni alimentari. Campionamento e diagnosi di laboratorio.
Cocchi Gram negativi:
Il genere Neisseria: proprietà generali, struttura, aspetto microscopico, coltivazione, suscettibilità ad agenti chimici e fisici. Neisseria meningitidis: classificazione, fattori di virulenza, epidemiologia, immunità. Patogenesi della meningite cerebrospinale epidemica. Vaccini antimeningococcici. Diagnosi di laboratorio di meningite meningococcca.
Bacilli Gram negativi:
Enterobatteri: morfologia e criteri generali di classificazione e di identificazione. Tifo addominale: patogenesi e diagnosi di laboratorio. Gastroenteriti da salmonelle non-tifoidee. Gastroenteriti causate da Escherichia coli patogeni.
Pseudomonas aeruginosa: caratteri morfologici e metabolici, coltivazione, diffusione. Fattori di virulenza cellulari e secreti. Infezioni nell'uomo. P. aeruginosa e la fibrosi cistica. Evoluzione dei ceppi mucoidi e loro adattamento all'ambiente polmonare. Diagnosi di laboratorio. La farmacoresistenza di P. aeruginosa.
Bacilli alcol-acido resistenti:
Mycobacterium tuberculosis: caratteristiche generali, proprietà tintoriali, specie di importanza medica, coltivazione, struttura. Epidemiologia della tubercolosi. Misure di controllo della tubercolosi. Patogenesi dell'infezione tubercolare. Il granuloma o tubercolo. Diagnosi di laboratorio. Il vaccino antitubercolare. Cenni di terapia antitubercolare.
Infezioni correlate all’assistenza (ICA): Definizione. Specie batteriche che causano infezioni ospedaliere. Biofilm. Fonti e vie di diffusione delle infezioni nosocomiali. Procedure per ridurre il rischio di trasmissione. Terapia antimicrobica.
VIROLOGIA GENERALE e SPECIALE
Caratteristiche generali dei virus. Struttura e classificazione. Il capside, l'involucro, gli acidi nucleici virali. Fasi dell'infezione virale. Replicazione dei virus animali a DNA ed RNA. Infezioni virali litiche, persistenti, latenti, trasformanti, abortive. Caratteri generali dei principali virus di interesse medico.
Retrovirus: Caratteristiche generali e classificazione. HIV: Caratteristiche morfologiche ed antigeniche. Ciclo di replicazione. Organizzazione del genoma virale e modalità di espressione dei geni. Proteine regolatorie e strutturali. Vie di trasmissione. Storia naturale dell'infezione da HIV attraverso il monitoraggio dei marcatori sierici. Infezioni opportunistiche in AIDS. Cenni di terapia antiretrovirale. Diagnosi di laboratorio.
Virus epatotropi: Caratteri morfologici, vie di trasmissione, tipi di infezione. Epidemiologia delle epatiti virali in Italia. I virus dell’epatite A, B e C. Caratteristiche morfologiche ed antigeniche. Ciclo di replicazione. Vie di trasmissione. Patogenesi dell'infezione e possibili evoluzioni. I principali marcatori sierici dell'infezione acuta e cronica. Vaccinazione e sieroprofilassi. Diagnosi di laboratorio
Coronavirus: Caratteristiche generali e classificazione. SARS-CoV-2: Ciclo di replicazione. Organizzazione del genoma virale e modalità di espressione dei geni. Vie di trasmissione. Storia naturale e patogenesi del Covid-19. Cenni di prevenzione e terapia. Diagnosi di laboratorio.
MICOLOGIA GENERALE e SPECIALE
Caratteri morfologici e strutturali della cellula fungina. Modalità di riproduzione e classificazione dei miceti. Caratteri generali delle principali micosi di interesse medico. Farmaci antimicotici.
PARASSITOLOGIA
Cenni di parassitologia. Caratteristiche generali e criteri di classificazione. Principali gruppi di protozoi ed elminti. Riproduzione sessuata ed asessuata. Caratteri generali dei principali protozoi di interesse medico. Malattie da protozoi. Ciclo vitale del parassita della malaria.
GENERAL MICROBIOLOGY
Bacterial structure and physiology:
General characteristics of the bacterial cell: differences between prokaryotes and eukaryotes. Classification of bacteria and taxonomy. The main groups of bacteria.
Bacterial cell morphology: Generalized structure of a bacterial cell. Bacterial cytoplasm. Cytoplasmic inclusions. Organization of the bacterial genome. Cell membrane: structure and functions. Wall: Peptidoglycan structure and functions in Gram + and Gram- bacteria. External membrane of Gram- bacteria. Structure and biological effects of lipopolysaccharide (endotoxin). Capsule: chemical composition, highlights, reports with bacterial virulence. Flagellas and pili: physiological role and virulence.
Bacterial Spore: Growth cycle of a sporogenic microorganism. Structure and formation of the spore. Germination and outgrowth. Resistance to heat.
Bacterial physiology: Nutritional needs of bacteria. Classification of bacteria in relation to oxygen demand for growth. Cultivation of microorganisms: solid, liquid, selective, discriminatory media. Arrichment culture. Pure culture isolation. Cultivation of anaerobic microorganisms. Growth curve in liquid media. Bacteria counting methods. Factors affecting the presence and duration of the various stages of growth.
Bacterial genetics: the organization of the bacterial genome; genetic variability in bacteria; mechanisms of DNA-fragment exchange among bacteria.
Chemotherapy and antibiotics:
Selective toxicity concept. Bacteriostatic and bactericidal activity of a drug. Mechanisms of action of the main antimicrobial drugs. Resistance factors: chromosomal (mutation) and extracromosomal (plasmid) resistance. Methods for assessing the susceptibility of bacteria to drugs: in solid (Kirby-Bauer method) and in liquid medium.
Immunity to infections:
General characteristics of the natural and acquired immune response. Definitions. Antigens. Antibodies. Structure of immunoglobulins (Ig), the main biochemical and biological properties of the different classes of Ig. Primary and secondary response to an antigenic stimulus. Protective action of antibodies in bacterial and viral diseases. Lymphocyte T. T cell lymphocyte recognition and their participation in immunity against infections.
Bacterial pathogenicity mechanisms:
Definition of contamination, infection, disease, pathogenicity, virulence. Normal bacterial flora. The opportunistic pathogens. Invasion mechanisms of bacteria and toxin production. Exotoxins and endotoxins.
CLINICAL MICROBIOLOGY
Gram positive cocci:
Staphylococci and streptococci: morphological and growth characteristics. Toxins and enzymes. Pathogenesis of infections sustained by Staphylococcus aureus and Streptococcus pyogenes. Laboratory Diagnosis. Main identification tests of the Gram positive cocci.
Gram positive bacilli:
Clostridium: General characteristics of Clostridium genus. Clostridium tetani, C. botulinum, C. perfringens, C. difficile. Pathogenesis of infection, toxins, clinical forms, food intoxication. Sampling and laboratory diagnosis.
Gram negative cocci:
Genus Neisseria: general properties, structure, microscopic appearance, cultivation, susceptibility to chemical and physical agents. Neisseria meningitidis: classification, virulence factors, epidemiology, immunity. Pathogenesis of epidemic cerebrospinal meningitis. Anti-menincococcal vaccines. Laboratory diagnosis of meningococcal meningitis.
Gram negative bacilli:
Enterobacteria: morphology and general criteria for classification and identification. Abdominal typhus: pathogenesis and laboratory diagnosis. Non-Typhoid Salmonella Gastroenteritis. Gastroenteritis caused by pathogenic Escherichia coli strains.
Pseudomonas aeruginosa: morphological and metabolic characteristics, cultivation, diffusion. Cellular and secreted virulence factors. Infections in humans. P. aeruginosa and cystic fibrosis. Evolution of mucoid strains and their adaptation to the lung environment. Laboratory Diagnosis. Pharmacoresistance mechaninsms of P. aeruginosa.
Alcohol-acid resistent bacilli:
Mycobacterium tuberculosis: general characteristics, tintorial properties, species of medical importance, cultivation, structure. Tuberculosis epidemiology. Tuberculosis control measures. Pathogenesis of tuberculosis infection. Granuloma or tubercle. Laboratory Diagnosis. The antituberculosis vaccine. Therapy of tuberculosis.
Health care associated infections (HAI): Definition. Bacterial species that cause hospital infections. Biofilm. Sources and routes of diffusion of nosocomial infections. Procedures to reduce the risk of transmission. Antimicrobial Therapy.
GENERAL AND SPECIAL VIROLOGY
General characteristics of viruses. Structure and classification. The capsid, the envelope, the viral nucleic acids. Phases of viral infection. Replication of DNA and RNA viruses. Viral, persistent, latent, transforming, abortive viral infections. General characters of major viruses of medical interest.
Retrovirus: General characteristics and classification. HIV: Morphological and antigenic characteristics. Replication cycle. Organization of the viral genome and expression of genes. Regulatory and structural proteins. Transmission routes. Natural history of HIV infection by monitoring serum markers. Opportunistic infections in AIDS. Antiretroviral therapy. Laboratory Diagnosis.
Hepatropic Viruses: Morphological characteristics, transmission paths, types of infection. Epidemiology of viral hepatitis in Italy. Hepatitis A, B and C viruses. Morphological and antigenic characteristics. Replication cycle. Transmission routes. Pathogenesis and possible evolutions of the infection. The main serum markers of acute and chronic infection. Vaccination and seroprophylaxia. Laboratory Diagnosis.
Coronavirus: General characteristics and classification. SARS-CoV-2: Replication cycle. Organization of the viral genome and mode of expression of genes. Routes of transmission. Natural history and pathogenesis of Covid-19. Introduction to prevention and therapy. Laboratory diagnosis.
GENERAL AND SPECIAL MICOLOGY
Morphological and structural features of the fungal cell. Reproduction of fungi and their classification. General features of the Main Mycoses of Medical Interest. Antimycotic drugs.
Parasitology
General characteristics and classification criteria of parasites. Main protozoa and helminth groups. Sexual and asexual reproduction. General features of the major protozoa of medical interest. Protozoal diseases. Vital Cycle of Plasmodium.
Prepararsi all'esame studiando sui testi di riferimento e seguendo gli schemi delle diapositive presentate a lezione.
Prepare for the exam by studying the reference texts and the slides presented in the lessons.
Esame scritto organizzato con domande a scelta multipla su tutti gli argomenti del corso.
Written examination organized with multiple choice questions on all the subjects of the course.
