ECTS - University of Pisa
Il corso di microbiologia clinica ha l’obiettivo di consentire allo studente di conoscere e di comprendere nozioni di base e conoscenze scientifiche aggiornate riguardanti le caratteristiche tassonomiche, morfologiche, fisiologiche, genetiche, patogenetiche, epidemiologiche, immunologiche, diagnostiche e farmacologiche dei principali batteri patogeni per l’uomo.
Il corso di parassitologia clinica ha l’obiettivo di consentire allo studente di conoscere e di comprendere nozioni di base e conoscenze scientifiche aggiornate riguardanti le caratteristiche tassonomiche, patogenetiche, epidemiologiche, immunologiche, diagnostiche dei principali parassiti di interesse umano.
The microbiology course aims to allow the student to know and understand updated basic knowledge and scientific knowledge concerning the taxonomic, morphological, physiological, genetic, pathogenetic, epidemiological, immunological, diagnostic and pharmacological characteristics of the main pathogenic bacteria for humans.
The clinical parasitology course aims to allow the student to know and understand updated basic knowledge and scientific knowledge dealing with the taxonomic, morphological, pathogenetic, epidemiological, immunological, diagnostic characteristics of the main human parasites.
Il corso di microbiologia clinica ha l’obiettivo di consentire allo studente di conoscere e di comprendere nozioni di base e conoscenze scientifiche aggiornate riguardanti le caratteristiche tassonomiche, morfologiche, fisiologiche, genetiche, patogenetiche, epidemiologiche, immunologiche, diagnostiche e farmacologiche dei principali batteri patogeni per l’uomo.
l corso di parassitologia clinica ha l’obiettivo di consentire allo studente di conoscere e di comprendere nozioni di base e conoscenze scientifiche aggiornate riguardanti le caratteristiche tassonomiche, patogenetiche, epidemiologiche, immunologiche, diagnostiche dei principali parassiti di interesse umano.
The student will be assessed on his/her ability to discuss course content using appropriate terminology. During the exam, the student must be able to demonstrate his/her knowledge of the main topics of the course and the ability to discuss, with critical awareness, issues relative to bacteria, epidemiology, pathogenesis, laboratory diagnosis of infectious diseases and measures to prevent them.
The student will be assessed on his/her ability to discuss course content using appropriate terminology. During the exam, the student should demonstrate his/her knowledge of the main topics of the course and the ability to discuss, with critical awareness, issues relative to human parasites, their epidemiology, pathogenesis, laboratory diagnosis as well as measures to prevent them.
Modulo di Microbiologia clinica - Programma
Diagnosi microbiologica ed immunologica delle infezioni batteriche. L'esame batterioscopico: allestimento di preparati; colorazioni di Gram, Ziehl, fluorocromica, blu di metilene, immunofluorescenza. Allestimento di preparati a fresco; sospensione in inchiostro di china, campo oscuro. Esame colturale dei campioni clinici. Isolamento in coltura pura. Terreni di coltura: nutrizionali, selettivi, discriminativi, di arricchimento. Criteri di identificazione batterica. Identificazione fenotipica, sierologica e molecolare dei batteri. Test primari e secondari di identificazione batterica. Il sistema MALDI-TOF. Principi dell'antibiogramma. MIC. Metodi per diffusione in agar e in mezzo liquido; E-test.
Batteriologia Speciale:
Streptococchi. Caratteri generali e classificazione. S. pyogenes: antigeni, fattori di patogenicità. Infezioni e malattie. Diagnosi di laboratorio di infezione da S. pyogenes. Titolo anti-SLO. Altri streptococci patogeni.
Pneumococco: caratteri generali, coltivazione, identificazione di laboratorio, antigeni. Patogenicità; infezioni e malattie pneumococciche. Vaccino. Farmaco-resistenza; Diagnosi di laboratorio.
Stafilococchi: generalità, classificazione e criteri di identificazione. S. aureus: caratteri generali, isolamento, coltivazione ed identificazione. Meccanismi di patogenicità; tossine; infezioni e malattie. Farmaco-resistenza. Diagnosi di laboratorio.
Micobatteri: proprietà generali, coltivazione e classificazione. M. tuberculosis: Epidemiologia della tubercolosi; Suscettibilità all'infezione tubercolare; Meccanismi patogenetici di M. tuberculosis. Infezione e malattia tubercolare. Farmaco-resistenza MDR e XDR. Vaccino anti-tubercolare. Diagnosi di infezione tubercolare latente: test tubercolinico e test IGRA. Diagnosi di laboratorio di tubercolosi: campioni clinici; trattamento dei campioni; esame microscopico e colturale. Criteri e test di identificazione fenotipici e molecolari per micobatteri. Antibiogramma per bacillo tubercolare; metodo proporzionale in mezzo liquido.
Enterobatteri: coltivazione e terreni di coltura. Classificazione, criteri e sistemi convenzionali ed automatizzati di identificazione. Infezioni e malattie da Enterobatteri. Identificazione biochimica e sierologica di Salmonella. Infezioni da Salmonella. Diagnosi di laboratorio e sierodiagnosi di Widal. Infezioni da Shigella e Yersinia. Infezioni opportunistiche da Enterobatteri.
Neisserie: caratteri generali e colturali. Gonococco e Meningococco: caratteri generali, classificazione, infezioni e diagnosi di laboratorio.
Cocco-bacilli gram negativi: caratteri generali, classificazione, criteri di isolamento ed identificazione, infezioni e malattie, diagnosi di laboratorio di Brucella e Haemophilus.
Pseudomonas aeruginosa: caratteri generali e colturali. Infezioni e diagnosi di laboratorio.
Clostridi: caratteri generali. Clostridium botulinum e Clostridium tetani: tossine, patogenesi, forme cliniche, diagnosi di laboratorio.
Modulo di Parassitologia clinica - Programma
Introduzione alla Parassitologia: importanza delle malattie parassitarie nella sanita' pubblica
Il rapporto ospite-parassita: aspetti biochimici ed immunologici
La toxoplasmosi: biologia del parassita e risposta dell'ospite
La toxoplasmosi: diagnosi di laboratorio
La malaria: biologia del parassita, risposta dell'ospite e diagnosi di laboratorio.
La leishmaniosi: biologia del parassita, risposta dell'ospite e diagnosi di laboratorio
Principali elmintiasi di interesse medico: echinoccosi, teniasi, ascaridiosi, schistosomiasi, trichinellosi
Le infezioni parassitarie nel soggetto immunoincompetente
Tecniche diagnostiche delle parassitosi ematiche
Tecniche diagnostiche delle parassitosi intestinali
Clinical Microbiology Module - Program
Microbiological and immunological diagnosis of bacterial infections. Bacterioscopic examination: preparation of preparations; Gram, Ziehl, fluorochromic, methylene blue, immunofluorescence stains. Preparation of fresh preparations; suspension in china ink, dark field. Cultural examination of clinical samples. Pure culture isolation. Culture media: nutritional, selective, discriminative, enrichment. Bacterial identification criteria. Phenotypic, serological and molecular identification of bacteria. Primary and secondary bacterial identification tests. The MALDI-TOF system. Principles of the antibiogram. MIC. Methods for diffusion in agar and in liquid medium; E-test.
Special Bacteriology:
Streptococci. General characteristics and classification. S. pyogenes: antigens, pathogenicity factors. Infections and diseases. Laboratory diagnosis of S. pyogenes infection. Anti-SLO title. Other pathogenic streptococci.
Pneumococcus: general characteristics, cultivation, laboratory identification, antigens. pathogenicity; pneumococcal infections and diseases. Vaccine. Drug-resistance; Laboratory diagnosis.
Staphylococci: general information, classification and identification criteria. S. aureus: general characteristics, isolation, cultivation and identification. Pathogenicity mechanisms; toxins; infections and diseases. Drug-resistance. Laboratory diagnosis.
Mycobacteria: general properties, cultivation and classification. M. tuberculosis: Epidemiology of tuberculosis; Susceptibility to tuberculous infection; Pathogenetic mechanisms of M. tuberculosis. Infection and tuberculous disease. Drug resistance MDR and XDR. Anti-tuberculous vaccine. Diagnosis of latent tuberculosis infection: tuberculin test and IGRA test. Laboratory diagnosis of tuberculosis: clinical samples; sample treatment; microscopic and culture examination. Phenotypic and molecular identification criteria and tests for mycobacteria. Antibiogram for tuberculous bacillus; proportional method in liquid medium.
Enterobacteria: cultivation and culture media. Conventional and automated classification, criteria and identification systems. Enterobacterial infections and diseases. Biochemical and serological identification of Salmonella. Salmonella infections. Laboratory diagnosis and Widal serodiagnosis. Shigella and Yersinia infections. Opportunistic infections with Enterobacteria.
Neisserie: general and cultural characteristics. Gonococcus and Meningococcus: general characteristics, classification, infections and laboratory diagnosis.
Coconut-bacilli gram negative: general characteristics, classification, isolation and identification criteria, infections and diseases, laboratory diagnosis of Brucella and Haemophilus.
Pseudomonas aeruginosa: general and cultural characteristics. Infections and laboratory diagnosis.
Clostridia: general characteristics. Clostridium botulinum and Clostridium tetani: toxins, pathogenesis, clinical forms, laboratory diagnosis.
Clinical Parasitology Module - Program
Introduction to Parasitology: importance of parasitic diseases in public health
The host-parasite relationship: biochemical and immunological aspects
Toxoplasmosis: parasite biology and host response
Toxoplasmosis: laboratory diagnosis
Malaria: parasite biology, host response and laboratory diagnosis.
Leishmaniasis: parasite biology, host response and laboratory diagnosis
Main helminthiasis of medical interest: echinoccosis, teniasis, ascaridiosis, schistosomiasis, trichinellosis
Parasitic infections in the immune-incompetent subject
Diagnostic techniques of blood parasitosis
Intestinal parasitosis diagnostic techniques
Principi di Microbiologia Medica 3° edizione di G. Antonelli et al., Casa Editrice Ambrosiana, 2017.
De Carneri Parassitologia medica e diagnosstica parassitologica di O. Brandonisio, Fabrizio Bruschi, Claudio Genchi e Edoardo Pozio, CEA, Milano, 2013.
Cancrini G. Parassitologia medica illustrata. III Ed. Edra, Milano, 2017.
Principi di Microbiologia Medica (third edition) of G. Antonelli et al., Casa Editrice Ambrosiana, 2017.
De Carneri Medical parasitology and parasitological diagnosis of O. Brandonisio, Fabrizio Bruschi, Claudio Genchi and Edoardo Pozio, CEA, Milan, 2013.
Cancrini G. Illustrated medical parasitology. III Ed. Edra, Milan, 2017.
Esame orale. E' prevista una prova in itinere per il modulo di Microbiologia Clinica.
Oral examination. An ongoing test is foreseen for the Clinical Microbiology module.
