Scheda programma d'esame
GENERAL ZOOTECHNY, GENETICS AND GENETIC IMPROVEMENT
ROBERTA CIAMPOLINI
Academic year2017/18
CourseVETERINARY MEDICINE
Code125GG
Credits6
PeriodSemester 1 & 2
LanguageItalian

ModulesAreaTypeHoursTeacher(s)
GENETICA VETERINARIAAGR/17LEZIONI38
ROBERTA CIAMPOLINI unimap
ZOOTECNICA GENERALE E MIGLIORAMENTO GENETICOAGR/17LEZIONI42
ROBERTA CIAMPOLINI unimap
Obiettivi di apprendimento
Learning outcomes
Conoscenze

GENETICA VETERINARIA Area Tematica "Genetica generale e molecolare"   

- Lo Studente deve possedere le nozioni fondamentali che lo mettano in condizione di comprendere:

  • i concetti alla base della Genetica classica, delle modalità di trasmissione dei caratteri
    ereditari, della struttura fine del gene e della Genetica molecolare per le specie animali in
    produzione zootecnica e le specie animali da compagnia.
  • i concetti alla base della Citogenetica: assetti cromosomici normali ed anomali delle specie
    animali in produzione zootecnica e delle specie da compagnia.
  • le moderne implicazioni della genetica molecolare nelle metodologie di
    valutazione genetica dei riproduttori per il miglioramento genetico delle specie zootecniche ai fini
    produttivi e per la corretta applicazione degli schemi di selezione genetica negli animali da
    compagnia;
  • le moderne implicazioni della genetica molecolare in campo clinico nello studio delle patologie
    a base genetica mono e multi fattoriale del Cane del Gatto e delle principali specie in
    produzione zootecnica con la finalità di comprendere i meccanismi di eradicazione delle patologie
    mono fattoriali attraverso la precoce individuazione dei riproduttori affetti, sani e portatori sani;
  • le moderne implicazioni della genetica molecolare in campo ispettivo: tracciabilità razziale ed
    individuale dei prodotti lattei e carnei cotti crudi e trasformati mediante marcatori genomici
    STR e SNP ed attraverso lo studio del polimorfismo genico dei loci alla base della colorazione
    dei mantelli. Metodo Probabilistico - Metodo Deterministico
  • le Applicazioni della Genetica Molecolare e le procedure da seguire nel rilascio dei Pedigree
    da parte dell’Ente Nazionale per la Cinofilia Italiana E.N.C.I.: Deposito e conservazione del
    Campione Biologico presso Laboratori accreditati, Profilo Genomico mediante marcatori
    Genomici STR, Test parentale (Esecuzione ed Interpretazione).

ZOOTECNICA GENERALE E MIGLIORAMENTO GENETICO  Area Tematica Produzione animale e allevamento

- Lo Studente deve possedere le conoscenze fondamentali per la comprensione:

  • I concetti di evoluzione, speciazione e di variabilità genetica.
  • di come la Variabilità Genetica abbia permesso il processo di domesticazione e di costituzione delle attuali razze allevate per le specie da reddito e da compagnia che verranno descritte etnologicamente.
  • nella parte di Zootecnica Generale, le principali caratteristiche del settore dell'allevamento degli animali da reddito.
  • i concetti alla base della genetica di popolazione insieme alle basi teoriche della genetica quantitativa e le applicazioni al settore del miglioramento genetico degli animali da reddito e da compagnia.
  • Le Metodologie di valutazione e di gestione della Variabilità Genetica utilizzate nei programmi di selezione.
  • la teoria alla base degli indici di Selezione, Le strategie e gli obiettivi dei programmi di selezione e le applicazioni della genetica Molecolare nell’Animal Breeding.
  • Le applicazioni concrete e la struttura dei programmi di miglioramento genetico operanti in Italia e gestiti dai Principali Centri di Miglioramento Genetico quali: ANAFI - ANABORAPI – ANABIC – ASSONAPA – ANRAB - ANAPRI - Genetica Italiana ANAS - UNIRE-
Knowledge

Veterinary Genetics TOPIC General and molecular genetics

The student must possess the fundamentals that make him able to understand:
the basic concepts of classical genetics, , fine gene structure and molecular genetics for animal species in livestock production and pet species.
the basic concepts of Cytogenetics: normal and abnormal chromosomal patterns of the species
animals in zootechnical production and of the species of companionship.
The modern implications of molecular genetics in the methodologies of genetic evaluation of breeding animals for the genetic improvement of animal husbandry for purposes
and for the correct application of genetic selection schemes in pet species;
The modern implications of molecular genetics in the clinical field in the study of pathologies
Cat and Dog Factor Mono and Multi Factorial Genetic Base and Major Species in
zootechnical production with the aim of understanding the mechanisms of eradication of pathologies
mono fatty acids through the early detection of affected, healthy and healthy reproducers;
the modern implications of molecular genetics in the field of investigation: racial traceability and
individual products of raw and processed meat produced and processed by genomic markers
STR and SNP and through the study of the genetic polymorphism of the loci at the base of the staining
of the cloaks. Probabilistic Method - Deterministic Method
the Applications of Molecular Genetics and the procedures to be followed in the release of Pedigree
by the Italian Kennel Club E.N.C.I .: Deposit and Conservation of the
Biological Sample at Accredited Laboratories, Genomic Profile by Markers
Genomics STR, Parental Test (Execution and Interpretation).

GENERAL ANIMAL BREEDING  AND GENETIC IMPROVEMENT TOPIC Animal Production and breeding


- The student must possess the basic knowledge for understanding:
The concepts of evolution, speciation and genetic variability.
of how Genetic Variability has allowed the process of domestication and constitution of current breeds  and companionship that will be described ethnologically.
in General Animal Breeding section, the main characteristics of the livestock breeding sector.
the basic concepts of population genetics along with the theoretical basis of quantitative genetics and the applications to the genetic improvement of animal and pet animals.
The Genetic Variability Evaluation and Management Methodologies used in the selection programs.
the theory behind the generation of selection indexes, the strategies and goals of the selection programs and the applications of Molecular Genetics in Animal Breeding.
The concrete applications and structure of the genetic improvement programs operating in Italy and managed by the Principal Genetic Enhancement Centers such as ANAFI - ANABORAPI - ANABIC - ASSONAPA - ANAS Italian Genetics.

Modalità di verifica delle conoscenze

GENETICA VETERINARIA Area Tematica "Genetica generale e molecolare   - L'accertamento delle conoscenze avverrà tramite prova scritta su piattaforma informatizzata. La prova verterà sugli argomenti trattati nel corso delle lezioni frontali e delle esercitazioni pratiche svolte in laboratorio Informatico su Piattafroma Moodle dell' Università di Pisa.

ZOOTECNICA GENERALE E MIGLIORAMENTO GENETICO Area Tematica Produzione animale e allevamento

- L'accertamento delle conoscenze avverrà tramite prova scritta su piattaforma informatizzata. con risoluzione di esercizi pratici, con domande aperte e riconoscimento dei test genetici di depistaggio per delle patologie a base genetica utilizzabili per le diverse  razze relative alle specie animali in produzione zootecnica e  da compagnia.

Assessment criteria of knowledge

VETERINARY GENETICS TOPIC General and molecular genetics Thematic area "General and Molecular Genetics - Knowledge assessment will be carried out through a written test on a computerized platform. The test will focus on the topics discussed during the frontal lessons and practical exercises carried out in the Computer Laboratory at Platform Moodle of the University of Pisa .


GENERAL ANIMAL BREEDING  AND GENETIC IMPROVEMENT- TOPIC Animal Production and breeding

The assessment of the knowledge will take place via written test on a computerized platform, with practical exercises resolution, with open questions. Identification of genetic tests that can be used for breeds of the animal species in zootechnical production, and breeds of pet species.

Capacità

GENETICA VETERINARIAArea Tematica "Genetica generale e molecolare

  • Lo studente sarà in grado di applicare i modelli di trasmissione ereditaria per caratteri semplici e complessi e di individuare i casi ererditari dovuti alle estensioni delle leggi di Mendel.
  • Lo studente sarà in grado di prelevare e conservare i campioni biologici sia ai fini del depistaggio delle malattie genetiche che delle analisi richieste dell’Ente Nazionale per la Cinofilia Italiana E.N.C.I. per le le procedure da seguire nel rilascio dei Pedigree e sarà in grado di interpretare il referto di un test parentale.
  • Lo studente sarà in grado di impostare un percorso di tracciabilità individuale e Razziale lungo tutta la filiera Produttiva Carne e Latte e sarà in grado di applicare le metodiche Probabilistiche e Deterministiche di tracciabilità nelle rispettive filiere produttive Carne e Latte.
  • Lo studente sarà in grado di applicare i moderni schemi di selezione genetica, saprà utilizzare i test di genetica molecolare nel depistaggio delle patologie del Cane del Gatto e delle principali specie in produzione zootecnica, ai fini dell’eradicazione delle patologie mono fattoriali attraverso l'individuazione precoce dei riproduttori affetti, sani e portatori sani;


ZOOTECNICA GENERALE E MIGLIORAMENTO GENETICOArea Tematica Produzione animale e allevamento

  • Lo Studente sarà in grado di comprendere come sono state costituite le attuali razze per le specie da reddito e da compagnia e di riconoscerle e classificarle etnologicamente.
  • Lo studente avrà acquisito le principali caratteristiche del settore dell'allevamento degli animali da reddito.
  • lo Studente a partire dai i concetti alla base della genetica di popolazione insieme alle basi teoriche della genetica quantitativa sarà in grado di impostare un piano di miglioramento genetico sia per gli animali da reddito chee da compagnia
  • lo Studente sarà in grado di valutare le strategie e gli obiettivi dei programmi di selezione anche alla luce delle applicazioni della genetica Molecolare nell’Animal Breeding.
  • lo Studente conoscerà le applicazioni concrete e la struttura dei programmi di miglioramento genetico operanti in Italia e gestiti dai Principali Centri di Miglioramento Genetico quali: ANAFI - ANABORAPI – ANABIC – ASSONAPA – Genetica Italiana ANAS.
Skills

VETERINARY GENETICS - TOPIC General and molecular genetics
The student will be able to apply inherited transmission models for simple and complex characters and to identify ererditary cases due to extensions of Mendel's laws.
The student will be able to pick up and store the biological samples both for the purpose of screening of genetic diseases and of the required analyzes of the Italian Kennel Club E.N.C.I. for the procedures to be followed in the release of Pedigree and will be able to interpret the report of a parental test.
The student will be able to set up an Individual and Breed Traceability path across the entire Milk and Milk Production Line and will be able to apply Probabilistic and Deterministic Traceability Methods in their respective Meat and Milk Production Chains.
The student will be able to apply the modern genetic selection schemes, will use molecular genetic testing in the screening of Cat Dog Pathologies and major species in zootechnical production, for the purpose of eradicating monofactorial pathologies.

GENERAL ANIMAL BREEDING  AND GENETIC IMPROVEMENT TOPIC Animal Production and breeding

The student will be able to understand how the current farm and pet breeds were constitued and to recognize and classify them as ethnologically.
The student will acquire the main characteristics of the livestock farming sector.
The student, starting from the basic concepts of population genetics together with the theoretical bases of quantitative genetics, will be able to set up a genetic improvement plan both for pet-living and companion animals.
The student will be able to evaluate the strategies and objectives of the selection programs also in the light of the applications of Molecular Genetics in Animal Breeding.
The student will know the concrete applications and structure of the genetic improvement programs in Italy and managed by the Principal Genetic  Centers such as ANAFI - ANABORAPI - ANABIC - ASSONAPA - ANAS Italian Genetics.

Modalità di verifica delle capacità

GENETICA VETERINARIA Area Tematica "Genetica generale e molecolare"- L'accertamento delle capacità è  svolto mediante interattività esercitativa svolta presso il laboratorio informatizzato del Polo informatico Piagge mediante la piattaforma infromatizzata Moodle dell' Università di Pisa.

ZOOTECNICA GENERALE E MIGLIORAMENTO GENETICO Area Tematica Produzione animale e allevamento

-L'accertamento delle capacità è svolto mediante interattività esercitativa svolta presso il laboratorio informatizzato del Polo informatico Piagge mediante la piattaforma infromatizzata Moodle dell' Università di Pisa.

 

Assessment criteria of skills

VETERINARY GENETICS - TOPIC General and molecular geneticsThe assessment of the skills is carried out through an interactive activity carried out at the computerized laboratory of the Piagge informatics pole using the Moodle computerized platform of the University of Pisa.


GENERAL ANIMAL BREEDING  AND GENETIC IMPROVEMENTTOPIC Animal Production and breeding

The assessment of the capacities is carried out by means of interactive activity carried out at the computerized laboratory of the Piagge informatics field through the computerized Moodle platform of the University of Pisa.

Comportamenti

GENETICA VETERINARIA Area Tematica "Genetica generale e molecolare" - Lo studente durante le esercitazioni  dovrà saper interagire con i compagni di corso nelle esercitazioni previste a gruppi, dovrà saper interpretare efficacemente gli approfondimenti delle esercitazioni  e delle metodologie applicate spiegati a lezione, inoltre dovrà comportarsi in maniera consapevole, critica ed interattiva riguardo agli argomenti trattati.

ZOOTECNICA GENERALE E MIGLIORAMENTO GENETICO Area Tematica Produzione animale e allevamento

- Lo studente durante le esercitazioni  dovrà saper interagire con i compagni di corso nelle esercitazioni previste a gruppi, dovrà saper interpretare efficacemente gli approfondimenti delle esercitazioni  e delle metodologie applicate spiegati a lezione, inoltre dovrà comportarsi in maniera consapevole, critica ed interattiva riguardo agli argomenti trattati.

Behaviors

VETERINARY GENETICS - TOPIC General and molecular geneticsThe student during the exercises should be able to interact with the classmates in the exercises planned for groups, be able to effectively understand the in-depth analysis of the exercises and the applied methodologies explained in lesson, and must behave in a conscious, critical and interactive way for the Topics covered.  

GENERAL ANIMAL BREEDING  AND GENETIC IMPROVEMENT- TOPIC Animal Production and breedingThe student during the exercises should be able to interact with the classmates in the exercises planned for groups, be able to effectively interpret the in-depth lessons learned in the exercises and the applied methodologies, and  and must behave in a conscious, critical and interactive way for the Topics covered.

Modalità di verifica dei comportamenti

GENETICA VETERINARIA Area Tematica  "Genetica generale e molecolare"- Durante le attività pratiche il docente valuterà il comportamento degli studenti e la loro capacità di interazione con il Docente e con i compagni di corso tramite l'osservazione della correttezza delle attività svolte e valutando le proprietà di linguaggio dello studente.

ZOOTECNICA GENERALE E MIGLIORAMENTO GENETICO Area Tematica Produzione animale e allevamento

-Durante le attività pratiche il docente valuterà il comportamento degli studenti e la loro capacità di interazione con il Docente e con i compagni di corso tramite l'osservazione della correttezza delle attività svolte e valutando le proprietà di linguaggio dello studente.

Assessment criteria of behaviors

VETERINARY GENETICSTOPIC General and molecular genetics During practical activities, the teacher will evaluate student behavior and their ability to interact with the teacher and their companions by observing the correctness of the activities and evaluating the student's language properties.


GENERAL ANIMAL BREEDING  AND GENETIC IMPROVEMENT- TOPIC Animal Production and breedingDuring the practical activities, the teacher will evaluate student behavior and their ability to interact with the teacher and their classmates by observing the correctness of the activities and evaluating the student's language skills.

Prerequisiti (conoscenze iniziali)

GENETICA VETERINARIAArea Tematica "Genetica generale e molecolare" Avere  conoscenze di base relative alle materie quali la Chimica la Biochimica e la Biologia 

ZOOTECNICA GENERALE E MIGLIORAMENTO GENETICO Area Tematica Produzione animale e allevamento

- avere acquisito le conoscenze fornite attraverso il programma svolto nel corso dell'insegnameto di Genetica Veterinaria 

Prerequisites

VETERINARY GENETICS - TOPIC General and molecular geneticsTo have basic knowledge of subjects such as Chemistry, Biochemistry and Biology

GENERAL ANIMAL BREEDING  AND GENETIC IMPROVEMENT- TOPIC Animal Production and breedingto acquire the knowledge provided through the program carried out during the course of Veterinary Genetics 

Indicazioni metodologiche

MODULO GENETICA VETERINARIA -    

Didattica teorica:  33 ore lezioni (lectures) con ausilio di slides 

Area Tematica "Genetica generale e molecolare"

Didattica pratica:  5 ore 

Area Tematica "Genetica generale e molecolare"

Lavoro di gruppo con supervisione (Seminars): 3ore

Sessioni Individuali di Autoapprendimento (Supervised self Learning): 0 ore

In Laboratorio o in aula (Laboratory and desk-based work): 0 ore

Didattica pratica non clinica che coinvolge animali, carcasse o materiale di origine animale (non clinical animal work) 2ore

Didattica pratica clinica all' interno delle strutture dell' Università (clinical animal work intramural) 0 ore

Didattica pratica clinica all' esterno alle strutture dell'Università (clinical animal work extramural) 0 ore

Modulo ZOOTECNICA GENERALE E MIGLIORAMENTO GENETICO 

Didattica teorica: 30 ore lezioni (lectures) con ausilio di slides 

Area Tematica Produzione animale e allevamento

Didattica pratica: 10 ore

Area Tematica Produzione animale e allevamento

Lavoro di gruppo con supervisione (Seminars): 4 ore

Sessioni Individuali di Autoapprendimento (Supervised self Learning): 0 ore

In Laboratorio o in aula (Laboratory and desk-based work): 6 ore

Didattica pratica non clinica che coinvolge animali, carcasse o materiale di origine animale (non clinical animal work) 0ore

Didattica pratica clinica all' interno delle strutture dell' Università (clinical animal work intramural) 0 ore

Didattica pratica clinica all' esterno alle strutture dell'Università (clinical animal work extramural) 0 ore                                                                   

 

Teaching methods

VETERINARY GENETICS  TOPIC General and molecular geneticsGeneral and molecular genetics
The didactic activity of the course includes a theoretical part during which the student attends lectures using the teaching material presented at the lesson available from the beginning of the course on the E-learnig site of the Department of Veterinary Sciences and an exercise part of in-depth study according to the following scheme:


Lectures: 27 h by using power point slides

 

PRACTICAL TRAINING: 5h


Seminars 3 h: Presentation of bibliographic material, links to sites related to the major research genetic centers and services for genetic testing used in the screening animal monofactorial diseases. Presentation of full-class classroom videos about the topics of genetics applied to the veterinary profession. Direct access and interaction by the student to the above mentioned material from a single PC or Mac station at the Computerized Laboratory of the Polo Infomatico Piagge using the Moodle computerized platform of the University of Pisa


Non clinical animal work 2h:  Practical Full-class Practice and Single Group with HBDD Molecular Dogs RIS Roma Certified in Searching for Missing Persons Actually in the Subject of the Program Concerning the Genetic Bases of Dog Slain

 

Module 2 GENERAL ANIMAL BREEDING  AND GENETIC IMPROVEMENTTOPIC Animal Production and breeding

Lectures: 32  h by using power point slides


PRACTICAL TRAINING: 10h


Laboratory and desk-based work 4 h At the Informatized Lab of the Polo Piagge on Moodle Computerized Platform of the University of Pisa. From the computerized material provided, the student will interact through the connection to the sites of the main genetic centers for animal selection working in Italy, to compile the linear phenotypic evaluation method at the basis of the plans for the calculation of the genetic indexes for the purposes genetic improvement.


Laboratory and desk-based work 6 hLaboratory and desk-based work at the Piagge Polo Computer Laboratory on Moodle Computerized Platform at the University of Pisa. Recognition of Canine, and Feline breeds. Recognition of Bovine, Sheep, Goat, Horses, Pigs, Avicole, and verification of the student's knowledge of their respective production attitudes and breeding technologies. Interaction of the student with the sites of gentic centers of selection for the identification of the main existing genetic tests used in the screening of the mono-factorial pathologies for all the animal species listed above - the subdivision into groups of 4 students will allow the students involved in the exercise to whole class to perform concurrent exercises related to the topics listed above for groups of different species.

Programma (contenuti dell'insegnamento)

GENETICA VETERINARIA

DIDATTICA TEORICA: 33 ore   

(3h) Richiami sulla struttura, composizione chimica, e funzione degli acidi nucleici. L’organizzazione del DNA nei cromosomi. Dimensione dei Genomi delle Specie animali in produzione zootecnica e da compagnia. Contenuto del DNA Ripetuto, DNA a Sequenza Unica ed a Sequenza Ripetuta. Replicazione e Ricombinazione del DNA. La Trascrizione. Il codice genetico e la traduzione. Genetica molecolare Nozioni di base. Il Gene: struttura chimica, meccanismi d'azione, criteri di studio. 

(3h) Tecniche di interazione con gli acidi Nucleici. Estrazione del DNA Genomico da substrati diversi. L'Elettroforesi su gel di Agarosio e su gel Di Poliacrilamide. Amplificazione in Vitro del DNA la tecnica della P.C.R. Polymerase Chain Reaction. Il Sequenziamento del DNA Metodica di Sanger. Automatizzazione della Metodica di Sanger il funzionamento dei Sequenziatori automatici del DNA. Esempi pratici delle applicazioni in campo zootecnico e cinotecnico delle suddette tecniche laboratoristiche. 

(3h) L'individuo, Genotipo, Fenotipo. Le teorie dell'eredità. Le leggi di Mendel: Gli esperimenti di Mendel. I risultati degli incroci monoibridi, Interpretazione dei dati, Il quadrato di Punnett,ESPERIENZE DI POLIBRIDISMO. La teoria cromosomica dell’eredità.L’analisi del pedigree. Estensioni dell’analisi mendeliana Modalità ereditarie di singoli geni.La funzione delle Proteine Spiega il Fenomeno della Dominanza. Dominanza incompleta, Codominanza. 

(3h) Penetranza ed Espressività, La polidattilia nei polli, Ambiente interno ed esterno, Età d’insorgenza,Sovradominanza. Allelia multipla. Modalità ereditaria dei Geni legati al Cromosoma X. Eredità Diandrica e Olandrica. Geni Pseudo Autosomici, Carattei Influenzati dal Sesso. Caratteri Limitati dal Sesso.Alleli Letali nell' Uomo, Bovino Ovino,Suino, Cavallo,Gatto e Cane.Effetti Pleiotropici dei Geni. Geni Modificatori ed interazioni Geniche. L'Epistasi, La Complementazione.Epistasi Recessiva nel colore del Mantello del Labrador. Ridondanza Genica. Fenomeni di Associazione Genica e Scambio. Il Concetto di Mappa Genetica. 

(3h) Eredità Extranucleare non mendeliana. Effetto Materno, Eredità Epigenetica, Imprinting Genomico, Eredità Materna, il Genoma Mitocondriale ed il Genoma dei Cloroplasti modalità di trasmissione Ereditaria. Effetto Materno ed Eredità Materna, concetti a confronto. La Teoria dell'Endosimbiosi. Polimorfismi Genetici ed Origini dei Polimorfismi del DNA. Definizione di Polimorfismo Genetico, Definizione di Variabilità Genetica.Utilizzo del Polimorfismo Genetico a Scopi Selettivi per il miglioramento genetico delle Produzioni Animali. 

(3h)I Marcatori Genomici SNP e STR loro Utilizzo. Come si Costruisce un Profilo Genomico con i Marcatori STR. Come si Effettua un Test Parentale. La Genetica Molecolare nelle procedure ENCI: Deposito e conservazione del Campione Biologico presso Laboratori accreditati.La tracciabilità dei prodotti carnei e lattei crudi cotti e trasformati. Tracciabilità effettuata con il metodo Probabilistico. 

(3h) Tecniche di Genetica molecolare e metodologie statistiche. La tracciabilità Individuale e Razziale della Carne Bovina. La Tracciabilità Razziale del latte bovino e dei prodotti derivati effettuata con ilmetodo Deterministico. Analisi del polimorfismo dei geni che determinano la colorazione e la pezzatura del mantello. La Tracciabilità delle produzioni carnee e lattee nella specie ovina mediante il metodo Probabilistico ed il metodo Deterministico 

(3h) Mappaggio dei genomi complessi e la Mappa Genomica delle principali specie in produzione zootecnica e degli animali da compagnia Applicazioni Pratiche in campo zootecnico: M.Genetica, M.Cromosomica, M.Fisica, M.Comparata. Stato dell'arte della mappa genomica di: Ruminanti, Suino, Equino, Pollo e delle specie da compagnia.QUANTITATIVE TRAIT LOCI (QTL) GENI AD EFFETTO MAGGIORE, MARKER ASSISTED SELECTION/ MARKER ASSISTED INTROGRESSION (MAS/MAI) GENOTYPE ASSISTED SELECTION (GAS). RICERCA DI QTL MEDIANTE L’IMPIEGO DI MARCATORI GENOMICI. 

(3h) Le basi genetiche della taglia e della conformazione corporea del cane. L'esempio dello studio effettuato nella razza Canina Portuguese Water Dog. Il Caso particolare del gene MSTN nella razza Canina Whippet. Le basi genetiche della longevità del cane e la loro correlazione della Taglia Corporea. QTL CFA 7; QTL CFA 8; QTL CFA 10; QTL CFA 15; QTL CFA 34; QTL CFA 23; QTL CFA 29; QTL CFA 9. Il Polimorfismo dei geni dei ricettori olfattivi del cane. Il polimorfismo dei marcatori genomici SNP correlato con l'attitudine innata nel riconoscere particolari molecole olfattive. Lo studio della base genetica delle malattie ereditarie del Cane e degli animali da reddito. Management delle Malattie Genetiche. Anomalie cromosomiche. Patologie monogeniche ed approcci di studio. Patologie multifattoriali ed approcci di studio. 

(3h) IDENTIFICAZIONE DEI GENI RESPONSABILI DELLE PRINCIPALI MALATTIE EREDITARIE. Approccio dei MARCATORI MOLECOLARI per la ricerca delle basi genetiche delle patologie multifattoriali, Epilessia, Displasia dell'anca etc. L'approccio di studio detto del Gene candidato, l'esempio della PRA Atrofia Progressiva della Retina del cane. Concetti alla base della Citogenetica Metodologie e criteri di studio dei cromosomi. Effetto Lyon Compensazione del Dosaggio genico, Corpo di Barr,le basi Molecolari dell'inattivazione del cromosoma X, Esempio della Colorazione del mantello nel gatto calico. 

(3h) Cariotipo ed Idiogramma delle principali specie in produzione zootecnica e delle specie da compagnia: Assetti cromosomici normali ed anomali delle specie animali in produzione zootecnica e delle specie da compagnia. Aberrazioni cromosomiche. Alterazioni del numero : polisomie e poliploidie. Non disgiunzione meiotica e mitotica. Anomalie di struttura. Delezioni. Duplicazioni. Inversioni pericentriche e paracentriche. Traslocazioni reciproche e robertsoniane. Citogenetica Molecolare e moderne tecniche di studio dei cromosomi. 

DIDATTICA PRATICA: 5 ore

3 h Lavoro di gruppo con supervisione (Seminars): presentazione di materiale bibliografico, link a siti riguardanti i principali centri di ricerca e servizi per i test genetici utilizzati nel depistaggio delle principali malattie a base genetica degli animali da compagnia e da reddito. Presentazione di filmati in aula  riguardanti gli argomenti di genetica applicata alla professione veterinaria. Accesso diretto ed interazione da parte dello studente al suddetto materiale da singola postazione pc o Mac presso il Laboratorio informatizzato del Polo Infomatico Piagge mediante la piattaforma informatizzata Moodle dell' Università di Pisa

2h Didattica pratica non clinica che coinvolge animali, Lavoro pratico con i cani Molecolari HBDD Certificati RIS Roma per la ricerca di persone scomparse in realzione all' argomento del programma che riguarda le basi genetiche del fiuto del cane

 

ZOOTECNICA GENERALE E MIGLIORAMENTO GENETICO  Area Tematica Produzione animale e allevamento

  • (2 ore) concetto ed importanza di biodiversità ed agro-biodiversità. Dalla domesticazione alla costituzione delle attuali razze allevate per le specie da reddito e da compagnia. 
  • (4 ore) le razze Bovine, Equine, Asinine, Suine, Ovine, Caprine, Canine e Feline:Descrizione Etnologica.
  • (2 ore)Concetti di Zootecnica Generale, Efficienza riproduttiva.
  • (1 ora)I sistemi di produzione. Le principali caratteristiche del settore dell'allevamento degli animali da reddito ed i suoi obiettivi.
  • (3 ore) I concetti alla base della Genetica di Popolazione: frequenze geniche e genotipiche; la legge di Hardy-Weinberg e la prova dell’equilibrio; la deriva genetica casuale, la migrazione, la mutazione e la selezione:
  • (3 ore) Le basi teoriche della genetica quantitativa. Caratteri qualitativi e quantitativi, effetti genetici, variabilità e le metodologie di valutazione e di gestione della Variabilità Genetica utilizzate nei programmi di selezione. 
  • (1 ora) I caratteri oggetto di selezione nelle specie di interesse zootecnico e da compagnia e le applicazioni al settore del miglioramento genetico.
  • (2 ore) Modello del singolo locus. Modello infinitesimale. Definizione di breeding value.
  • (2 ore) Ereditabilità, ripetibilità di un carattere quantitativo e correlazione genetica . Stima del breeding value: aspetti generali e concetto di accuratezza di stima del breeding value. Rassomiglianza fra individui.  
  • (2 ore) Rapporti di parentela additiva tra animali e il metodo tabulare. Consanguineità e i suoi effetti.
  • (3 ore) Regressione lineare. Metodi di valutazione genetica dei candidati riproduttori. Indici Genetici.
  • (1 ora)La risposta alla selezione e il progresso genetico
  • (2 ore) L’incrocio e la produzione degli ibridi commerciali  Selezione intra razza. Schemi di selezione.
  • (2 h)Esempi di applicazione delle biotecnologie genetiche al miglioramento genetico animale e impatto della selezione genomica 

Didattica pratica: TOTALE 10 ore

  • 6 ore Presso il laboratorio Informatizzato del Polo Piagge su Piattaforma informatizzata Moodle dell' Università di Pisa. A partire dal materiale informatizzato fornito lo Studente interagirà attraverso la connessione ai siti dei principali centri genetici per la selezione delle specie da reddito operanti in Italia, alla compilazione della scheda di valutazione fenotipica lineare alla base dei piani per il calcolo degli indici genetici ai fini miglioramento genetico dei riproduttori maschi e femmine.
  • 4 ore Presso il laboraorio Informatizzato del Polo Piagge su Piattaforma informatizzata Moodle dell' Università di Pisa. Riconoscimento delle razze Canine, e Feline. Riconoscimento delle razze Bovine, Ovine, Caprine, Equine, Suine, Avicole, e verifica delle conoscenze dello studente riguardanti le rispettive attitudini produttive e tecnologie di allevamento. Interazione dello studente con i siti dei centri gentici per l'individuazione dei principali test genetici esistenti utilizzati nel depistaggio delle patologie gentiche mono fattoriali per tutte le specie animali sopra elencate. 
Syllabus

VETERINARY GENETICS  TOPIC General and molecular genetics

Lectures: 33  h by using power point slides

3h Nucleic Acids Structure, chemical composition, and function. The DNA organization in chromosomes. Size of Animal Genomes for Livestock species and dog.DNA Single-Sequence and Repeated Sequence. DNA Replication and Recombination. The Transcription. The genetic code and the translation. Molecular Genetics Basics. The Gene: Chemical structure, mechanisms of action, study criteria. The Gene: Chemical structure, mechanisms of action, study criteria. The genic Transcription. The genetic code and the translation. 

3h Molecular Genetics Basics.Techniques of interaction with Nucleic Acids. Genomic DNA extraction from different substrates. The Electrophoresis on Agarose  and Poliacrilamide Gel. DNA in vitro amplification by P.C.R. Polymerase Chain Reaction. DNA Sanger's Sequencing Methodical . Automation of Sanger Methodology The Automatic DNA Sequencers. Practical examples of zootechnical and cinotechnical applications of the above-mentioned laboratory techniques. 

3h The Individual, Genotype, Phenotype. Theories of inheritance. Mendel's Laws: Mendel's Experiments, Mono-hybrid Cross, Data Interpretation, Punnett's Square, POLYRIDISM EXPERIENCES. The chromosomal theory of inheritance. Pedigree analysis. Extensions of the Mendelian Analysis, Heredity of Individual Genes. Protein Function Explains Dominance Phenomenon. Incomplete Dominance, Co-dominance. 

3h Penetrance and Expression,  Chickens Polydactyly, Environment Internal and External, Age of Onset, Over-dominance. Multiples alleles. Inheritance of X-linked Genes. Diandria and Olandic inheritance. Pseudo Autosomal  Genes, Sex Influenzed Genes. Sex Limited  Genes.  Lethal Alleles in Man, Sheep, Pig, Horse, Cat and Dog. Pleiotropic Effects of Genes. Genes Modifiers and Genics Interactions. Epistasis, Complementation. Recessive Epistasis in the Labrador Breed Coat Color. Genic redundancy. Genic linkage and Exchange. The Genetic Map Concept. 

3h Extranuclear non-Mendelian inheritance. Maternal Effect, Epigenetic inheritance, Genomic Imprinting, Maternity, The Mitochondrial and  Chloroplast Genome Transmission Mode. Concepts Comparation of Maternal Effect and inheritance Maternal . The Endosymbiosis Theory. Genetic Polymorphisms and Origins of DNA Polymorphisms. Definition of Genetic Polymorphism, Definition of Genetic Variability. Use of Genetic Polymorphism to Selective Goals for the Genetic Improvement of Animal Production. 

3h Genomic Markers SNP and STR Their Use. As it builds a genomic profile with STR markers. How Make a Parental Test. Traceability of meat and milk products. Traceability with Probabilistic Method. 

3h Molecular Genetics Techniques and Statistical Methodologies. Individual and breed traceability of beef. The Breed Traceability of Bovine Milk and Derived Products Made with the Deterministic Method. Analysis of the polymorphism of genes that determine the coat color. The Traceability of Carcass and Milk Production in Sheep by Probabilistic Method and Deterministic Method 

3h Complex genomic mapping. The Genomic map of the main species in livestock production. Applications in the field of zootechnics: Genetic Map, Chromosomic Map, Physic Map, Comparative Map. State of the art of the genomic map for: Ruminants, Pig, Equine, Chicken and Dog. QUANTITATIVE TRAIT LOCI (QTL), MARKER ASSISTED SELECTION/ MARKER ASSISTED INTROGRESSION (MAS/MAI) GENOTYPE ASSISTED SELECTION (GAS). finding QTL using genomic markers. 

3h The genetic basis of the dog's body size and conformation. The example of the study carried out in the "Portuguese Water Dog Breed". The particular case of the MSTN gene in the "Whippet Dog Breed". The QTL genetic basis of longevity of the dog and the correlation with the Body Size. QTL CFA 7; QTL CFA 8; QTL CFA10; QTL CFA 15; QTL CFA 34; QTL CFA23; QTL CFA 29; QTL CFA 9. Canine Olfactory Receptor Gene Polymorphysm. The polymorphism of SNP markers correlate whit the innate ability to detect particular olfactory molecules. The study of the genetic basis of hereditary diseases of the Dog and Livestock. Management of Genetic Diseases. Chromosomal anomalies. Monogenic pathologies and study approaches. Multifactorial pathologies and study approaches. 

 

3h IDENTIFICATION OF THE GENES RESPONSIBLE FOR THE MAIN HEREDITARY DISEASES. Approach of MOLECULAR MARKERS for the research of the genetic bases of multifactorial pathologies, Epilepsy, Hip dysplasia etc. The "Gene candidate approach", the case of study of the PRA Progressive Retinal Dog Atrophy. Concepts at the base of Cytogenetics Methodologies and criteria for the study of chromosomes. Lyon effect. Barr Body Compensation for Gene Dosage, Barr Body, Molecular Basics of X-Chromosome Inactivation, Example of Coat Color in Calico Cat. 

 

3h Cariotype and Ideogram in livestock and pets. Normal and abnormal Cariotypes in livestock and pets.: "Chromosomal aberrations. Alterations of Chromosomes Number: Polysomy and Polyploid. Alterations of Chromosomes structure. Deletions. Duplication. Pericentric and paracentric inversions. Mutual and robertsonian translocations. Molecular Cytogenetics and modern techniques of coromosome study . 

PRACTICAL TRAINING: 5h


Seminars 3 h:Presentation of bibliographic material, links to sites related to the major research genetic centers and services for genetic testing used in the screening animal monofactorial diseases. Presentation of full-class classroom videos about the topics of genetics applied to the veterinary profession. Direct access and interaction by the student to the above mentioned material from a single PC or Mac station at the Computerized Laboratory of the Polo Infomatico Piagge using the Moodle computerized platform of the University of Pisa


Non clinical animal work 2h: Practical Full-class Practice and Single Group with HBDD Molecular Dogs RIS Roma Certified in Searching for Missing Persons Actually in the Subject of the Program Concerning the Genetic Bases of Dog Slain

 

Module 2 GENERAL ANIMAL BREEDING  AND GENETIC IMPROVEMENTTOPIC Animal Production and breeding

Lectures: 32  h by using power point slides

Concepts of biodiversity and agrobiodiversity. From domestication to the constitution of current zootechnical breeds and companions breeds. (2 hours)
Bovine, Equine, Asinine, Pigs, Sheep, Goats, Dogs and Felines Breeds Ethnological Description (4 hours).
General Animal Husbandry, Reproductive Efficiency. Production systems.The main characteristics of the livestock farming sector and its objectives (2 hours).
The basic concepts of Population Genetics: genic and genotypic frequencies; the law of Hardy-Weinberg. genetic drift, migration, mutation and selection. Deviations from Hardy-Weinberg proportions (3 hours). The theoretical basis of quantitative genetics. Qualitative and quantitative characters, genetic effects, Managing Genetic Variation in Breeding Programmes (3 hours) Single Traits and Quantitative Traits under selecton in zootechnical breeds and companions breeds. Single locus model. Infinitesimal model (2 hours). Definition of breeding value (2 hours). heritability, repeatability of a quantitative trait and genetic correlation (2 hours). Breeding value estimation: general aspects and concept of estimation accuracy of the breeding value (2 hours). Additive relationships among individuals
and The Tabular Method Inbreeding its Effects and Applications in Breeding (2 hours). Linear regression. Genetic Evaluation Methodology and Selection Index Theory of Breeding Programmes. (3 hours). Response to selection and genetic progress (2 hours) Cross breeding and production of commercial hybrids (1 hour) Intrabreed selection. Selection schemes. Strategies and Objectives Application of Molecular Genetics and genetic biotechnology in Animal Breeding (2 h)

 


PRACTICAL TRAINING: 10h


Laboratory and desk-based work 6 h At the Informatized Lab of the Polo Piagge on Moodle Computerized Platform of the University of Pisa. From the computerized material provided, the student will interact through the connection to the sites of the main genetic centers for animal selection working in Italy, to compile the linear phenotypic evaluation method at the basis of the plans for the calculation of the genetic indexes for the purposes genetic improvement.


Laboratory and desk-based work 4 h Laboratory and desk-based work at the Piagge Polo Computer Laboratory on Moodle Computerized Platform at the University of Pisa. Recognition of Bovine, Sheep, Goat, Horses, Pigs, Avicole breeds and verification of the student's knowledge of their respective production attitudes and breeding technologies. Interaction of the student with the sites of gentic centers of selection for the identification of the main existing genetic tests used in the screening of the mono-factorial pathologies for all the animal species listed above - the subdivision into groups of 4 students will allow the students involved in the exercise to whole class to perform concurrent exercises related to the topics listed above for groups of different species.

 

 

Bibliografia e materiale didattico

GENETICA VETERINARIA    

Principi di Genetica di Robert J. Booker e A. Russo McGraw-Hill Education (Italy) srl

Il Materiale relativo alle lezioni tenute ed alle esercitazioni, nonchè la bibliografia più attuale relativa agli argomenti trattati durante il corso sono a disposizione dello studente in formato PDF presso la piattaforma Elearning del Dipartimento di Scienze Veterinarie. https://elearning.vet.unipi.it/

ZOOTECNICA GENERALE E MIGLIORAMENTO GENETICO- ZOOTECNICA GENERALE E MIGLIORAMENTO GENETICO  

“Genetica Animale- Applicazioni zootecniche e veterinarie.” Giulio Pagnacco Seconda Edizione. Casa Editrice Ambrosiana.

"Selezione Genomica della Vacca da latte - Dove Siamo e Dove Andiamo" Fabiola Canavesi Edizioni Le Point Veterinaire Italie

Il Materiale relativo alle lezioni tenute ed alle esercitazioni, nonchè la bibliografia più attuale relativa agli argomenti trattati durante il corso sono a disposizione dello studente in formato PDF presso la piattaforma Elearning del Dipartimento di Scienze Veterinarie. https://elearning.vet.unipi.it/

 

Bibliography

VETERINARY GENETICS TOPIC General and molecular genetics

The material for lessons and exercises, as well as the most current bibliography on the subjects covered during the course, are available to the student in PDF format at the Elearning Platform of the Department of Veterinary Sciences. https://elearning.vet.unipi.it/

Principi di Genetica di Robert J. Booker e A. Russo McGraw-Hill Education (Italy) srl

GENERAL ANIMAL BREEDING  AND GENETIC IMPROVEMENT TOPIC Animal Production and breeding

The material for lessons and exercises, as well as the most current bibliography on the subjects covered during the course, are available to the student in PDF format at the Elearning Platform of the Department of Veterinary Sciences. https://elearning.vet.unipi.it/.

“Genetica Animale- Applicazioni zootecniche e veterinarie.” Giulio Pagnacco Seconda Edizione. Casa Editrice Ambrosiana.

Indicazioni per non frequentanti

Il corso è a frequenza obbligatoria attestata mediante il recupero delle firme in aula. Gli studenti lavoratori e gli studenti con specifici problemi possono richiedere al Corso di Laurea esenzioni specifiche della frequenza.

 

Non-attending students info

VETERINARY GENETICS TOPIC General and molecular genetics

GENERAL ANIMAL BREEDING  AND GENETIC IMPROVEMENT TOPIC Animal Production and breeding

 

Assisting lectures and practical sessions is mandatory unless specific authorization had been approved by the establishment.

Modalità d'esame

GENETICA VETERINARIA Area Tematica "Genetica generale e molecolare"-La prova di Esame viene effettuata in modalità informatizzata presso il Polo Tecnologico 5 Dell'Università di Pisa su Piattaforma informatizzata Moodle dell'Università di Pisa. Il compito è composto da  Domande a risposta multipla ed in formato chiuso.

ZOOTECNICA GENERALE E MIGLIORAMENTO GENETICOArea Tematica Produzione animale e allevamento

La prova di Esame viene effettuata in modalità informatizzata presso il Polo Tecnologico 5 Dell'Università di Pisa su Piattaforma informatizzata Moodle dell'Università di Pisa. Il compito è composto sia da  Domande a risposta multipla ed in formalto chiuso che da domande che prevedono lo svolgimento per step successivi di esercizi.

Assessment methods

VETERINARY GENETICSTOPIC General and molecular genetics The Exam Testing is performed in computerized form at the at the Computerized Laboratory of the Polo Infomatico Piagge using the Moodle computerized platform of the University of Pisa. The task is composed of multiple-choice and closed-ended questions.

GENERAL ANIMAL BREEDING  AND GENETIC IMPROVEMENT - TOPIC Animal Production and breeding

The Exam Testing is performed in computerized form at the at the Computerized Laboratory of the Polo Infomatico Piagge using the Moodle computerized platform of the University of Pisa. The task is composed of both Multiple-Answered and Closed-All Questions, and questions that involve performing for subsequent work phases.

Altri riferimenti web

https://elearning.vet.unipi.it/

http://lbg.vet.unipi.it/

http://www.anabic.it/

http://www.anaborapi.it/

http://www.anarb.it/

http://www.anapri.eu/

http://www.anas.it/

http://geni.anas.it/

http://www.assonapa.it/index.asp

http://www.anafi.it/

http://www.agraria.org/zootecnia.htm

http://www.enci.it/

http://www.anagrafenazionalefelina.it/razze.php

https://www.unirelab.it/

http://www.anagrafeequidi.it/menu.php?

Additional web pages

https://elearning.vet.unipi.it/

http://lbg.vet.unipi.it/

http://www.anabic.it/

http://www.anaborapi.it/

http://www.anarb.it/

http://www.anapri.eu/

http://www.anas.it/

http://geni.anas.it/

http://www.assonapa.it/index.asp

http://www.anafi.it/

http://www.agraria.org/zootecnia.htm

http://www.enci.it/

http://www.anagrafenazionalefelina.it/razze.php

https://www.unirelab.it/

http://www.anagrafeequidi.it/menu.php?

Note

GENETICA VETERINARIA Area Tematica "Genetica generale e molecolare"- Ricevimento Studenti su appuntamento richiesto e concordato tramite messaggio email al Docente

ZOOTECNICA GENERALE E MIGLIORAMENTO GENETICO - Area Tematica Produzione animale e allevamento

Ricevimento Studenti su appuntamento richiesto e concordato tramite messaggio email al Docente

Notes

VETERINARY GENETICS TOPIC General and molecular genetics

GENERAL ANIMAL BREEDING  AND GENETIC IMPROVEMENT TOPIC Animal Production and breeding

- Receiving Students by appointment requested and agreed by email to the Teacher

Updated: 26/02/2018 12:10