ECTS - University of Pisa
| Modules | Area | Type | Hours | Teacher(s) | |
| BIOINFORMATICA | INF/01 | LEZIONI | 21 |
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Al termine del corso lo studente avra aquisito conoscenze in merito all'analisi di dati biologici, medici, farmacologici usando strumenti informatici, incluso una visione globale sullo stato dell'arte rispetto a vari metodi mirati a diversi tipi di dato e fasi di analisi.
At the end of the course the student will have acquired knowledge in biological, medical and farmaceutical data analysis using computer science methods, including a global vision on the state of the art for different data types and analysis phases.
Progetto.
Project.
Al termine del corso:
lo studente saprà distinguere tra vari tipi di dato e metodi bioinformatici, e scegliere quelli più utili per un tema dato.
lo studente saprà utilizzare vari software di bioinformatica disponibili online.
lo studente saprà utilizzare delle basi di dati bio-mediche disponibili online.
lo studente sarà in grado di svolgere una ricerca della letteratura su un tema bioinformatico.
lo studente sarà in grado di presentare in una relazione scritta i risultati dell'attività progettuale svolta.
lo studente sarà in grado di presentare oralmente l'attività progettuale.
At the end of the course:
The student will be able to distinguish between data types and bioinformatics methods, being able to choose those suitable for a certain research topic.
The student will be able to use different bioinformatics software tools available online.
The student will be able to use biomedical databases availabel online.
The student will be able to conduct research of the state of the art on a given subject in bioinformatics.
The student will be able to present a written report on the project activities.
The student will be able to present orally the project activities.
Progetto.
Project.
Lo studente potrà acquisire abilità di sceglere tra vari metodi bioinformatici
Lo studente potrà sviluppare senso critico in merito alla scelta di dati biologici e metodi informatici per rispondere a una domanda di ricerca.
The student will be able to aqcuire the ability to choose between various metghods in bioinformatics.
The student will be able to develop skills for critical analysis of the choise of data and methods to answer a research question.
Progetto.
Project.
Matematica e statistica di base, biologia e genetica di base.
Basic mathematics, statistics, biology, genetics.
Lezioni frontali con slide di supporto.
Esercitazioni dove si domostrano vari tool disponibili online.
Frontal presentation with supporting slides.
Demonstration of various online tools.
Introduzione alla bioinformatica, terminologia e fasi di analisi.
Analisi automatica della letteratura.
Dati: tecnologie, livelli di misurazione, selezione, integrazione, basi di dati online, metodi di analisi, identificazione di biomarker, esempi di letteratura.
Analisi di pathway, esempi di letteratura.
Modelizzazione di sistemi biologici, esempi di letteratura.
Introduction to the field of bioinformatics, terminology and analysis phases.
Automatic literature review.
Data: technologies, measurements levels, data selection, integration, online databases, analisis methods, biomarker identification, examples from the literature.
Pathway analysis, examples from the literature.
Biological system modelling, examples from the literature.
Slide del corso e pubblicazioni scientifiche suggerite a lezione.
Slides and scientific pubblication cited during class.
Progetto: elaborato scritto più presentazione orale dell'attività di progetto.
Project: written report and oral presentation of activities.
