ECTS - University of Pisa
Al termine del corso lo studente conoscerà le tecniche computazionali moderne per analizzare insiemi di dati biomedici complessi. Lo studente avrà inoltre la comprensione di cosa sono e come sono strutturate le basi di dati.
Esame scritto
Al termine del corso lo studente avrà acquisito la capacità di individuare gli strumenti computazionali più adeguati alle problematiche biomediche e avrà la capacità di distinguere e comprendere i vari tipi di dato disponibili nel settore. Sarà inoltre in grado di accedere a risorse di pubblico dominio quali basi di dati e siti specialistici per analisi computazionali. Lo studente riuscirà ad interrogare basi di dati costruendo sempllici queries in linguaggio SQL.
Esame scritto
Lo studente potrà consapevolmente selezionare le metodiche più adeguate e i tipi di dati migliori per rispondere alle esigenze di analisi e sperimentazione.
Esame scritto
Elementi basilari di statistica, biologia molecolare e biochimica.
Le lezioni saranno lezioni frontali in cui vengono introdotte le tematiche. Alcune lezioni o parti di lezione presenteranno applicazioni pratiche e esercizi di preparazione alla prova finale. Saranno organizzate anche lezioni pratiche per l'utilizzo di tecnologie informatiche specifiche.
Introduzione alla biologia computazionale e all'informatica medica.
Principali problematiche affrontate mediante strumenti computazionali e pipeline ideale.
Text-mining
Integrazione di diversi tipi di dati mediante reti
Identificazione di biomarcatori
Analisi di pathway biologici
Modelli dinamic e simulazione
Risorse pubbliche disponibili
Rappresentazione e utilizzo dell'informazione, introduzione alle basi di dati e al linguaggio SQL
Le slide presentate alle lezioni e articoli scientifici suggeriti dal docente.
Esame scritto
