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MICROBIAL ECOLOGY
CLAUDIA VANNINI
Academic year2023/24
CourseENVIRONMENTAL SCIENCE
Code135EE
Credits6
PeriodSemester 1
LanguageItalian

ModulesAreaTypeHoursTeacher(s)
ECOLOGIA MICROBICABIO/05LEZIONI60
CLAUDIA VANNINI unimap
Obiettivi di apprendimento
Learning outcomes
Conoscenze

L’insegnamento si propone di fornire conoscenze sugli organismi microbici e il loro ruolo nell'ambiente e nelle applicazioni per il risanamento ambientale.

Lo studente che completi con successo il corso:

  • sarà in grado di descrivere la diversità dei microrganismi procariotici ed eucariotici;
  • dimostrerà conoscenza dell’ecologia, dell’evoluzione e del ruolo dei microrganismi negli ambienti naturali ed antropizzati;
  • conoscerà il ruolo dei microrganismi nelle principali tecniche di bio-risanamento.
Knowledge

The course aims to give knowledge on microbial organisms and their role in the environment and in methods for environmental remediation. 

A student who completes the course with success:

- will be able to describe prokaryotic and eukaryotic microbial diversity;

- will prove to know on microbial ecology, evolution and role in natural and anthropic environments;

- will know the role of microorganisms in the main bio-remediation techniques.

 

Capacità

L’insegnamento fornisce gli strumenti teorici e pratici per lo studio delle comunità microbiche.

Lo studente che completi con successo il corso

  • conoscerà i principi su cui si basano le principali tecniche per lo studio delle comunità microbiche;
  • saprà applicare le principali tecniche per lo studio delle comunità microbiche;
  • interpreterà e analizzerà correttamente i dati, anche in relazione a fattori biotici ed abiotici.
Skills

The course will give theorical and practical tools for studying microbial communities.

A student who completes the course with success:

- will know the principles at the basis of the main techniques for studying microbial communities;

- will be able to apply the main techniques for studying microbial communities;

- will accurately interpret and analyse the data, also in relation to abiotic and biotic factors.

Comportamenti

Lo studente che completi con successo il corso

  • apprenderà e saprà correttamente utilizzare la terminologia appropriata per descrivere la diversità, l’evoluzione e l’ecologia microbica e per descrivere e analizzare i dati relativi alle comunità ed alle singole componenti microbiche;
  • sarà in grado di mettere in relazione gli argomenti dell’insegnamento con le sue conoscenze biologiche di base.
Behaviors

A student who completes the course with success:

- will learn and accurately use the terminology appropriate for describing microbial diversity, evolution and ecology and for describing and analysing data concerning microbial communities and single microbial components;

- will be able to relate topics of the course with his/her basic biological knowledge.

Prerequisiti (conoscenze iniziali)

Lo studente è invitato a verificare l'esistenza di eventuali propedeuticità consultando il Regolamento del Corso di studi relativo al proprio anno di immatricolazione. Un esame sostenuto in violazione delle regole di propedeuticità è nullo (Regolamento didattico d’Ateneo, art. 24, comma 3).

Prerequisites

Students are invited to verify any mandatory prerequisite by reading the "Regolamento del Corso di studi" pertinent to the enrolment year (available on the degree website). Exams undertaken out of the rules are not valid (Regolamento didattico d’Ateneo, art. 24, comma 3).

Indicazioni metodologiche

Erogazione: lezioni frontali, attività di laboratorio.

Attività del discente:

  • frequenza delle lezioni
  • frequenza delle attività di laboratorio
  • partecipazione alle discussioni
  • studio individuale
  • ricerca bibliografica

Frequenza: almeno il 75% delle ore di laboratorio erogate (con eccezione di studenti lavoratori e genitori certificati).

Per gli studenti frequentanti il corso nell'AA 2020-2021, l'ammissione all'esame è subordinata allo svolgimento del progetto di analisi di dati con il programma QIIME2.

Teaching methods

Delivery: lectures, laboratory activities.

 

Learning activities:

- attending lectures

- attending laboratory activities

- take part to discussions

- individual study

- bibliography search

 

Attendance: minimum 75% hours of laboratory (certified workers and/or parents excluded)

For students attending in the Academic year 2020-2021, admission to the exam is subordinated to the execution of the data analyses project on QIIME2.

Programma (contenuti dell'insegnamento)

Il corso fornisce conoscenze sugli organismi microbici e il loro ruolo nell'ambiente e nelle applicazioni per il risanamento ambientale. Vengono trattate la diversità, l'ecologia e l'evoluzione degli organismi microbici procariotici ed eucariotici negli ambienti naturali e antropizzati e la loro utilità come strumenti essenziali in tecniche di bonifica di siti o matrici contaminate. Durante il corso vengono anche illustrate ed applicate le principali tecniche per lo studio delle comunità microbiche e per la comprensione della loro funzione in relazione a fattori biotici ed abiotici. A tal fine l'insegnamento prevede anche lo svolgimento di un numero consistente di ore di laboratorio (2 CFU).

Alla pagina personale del docente su UNIMAP, può essere consultato il link ai registri delle lezioni e dei laboratori svolti per questo insegnamento (https://unimap.unipi.it/registri/registri.php?ri=011605&tmplt=principale.tpl&aa=2021).

Syllabus

The course gives knowledge on microbial organisms and their role in the environment and in methods for environmental remediation. Diversity, ecology and evolution of prokaryotic and eukaryotic microbes in natural and anthropic environments, as well as their usefulness as essential tools in remediation of contaminated matrices and sites are described. During the course the main techniques for the study of microbial communities and for understanding their function in relation to abiotic and biotic factors are explained and applied. To this purpose, the course includes a considerable number of laboratory activity hours (2 CFU).

Register of the course with laboratories and lectures done in the past is available at the teacher’s web page on UNIMAP (https://unimap.unipi.it/registri/registri.php?ri=011605&tmplt=principale.tpl&aa=2021).

Bibliografia e materiale didattico

Diapositive delle lezioni (fornite di volta in volta tramite e-learning moodle UNIPI Polo3).

 

Prescott's microbiology.

9th edition.

Joanne Wiley, Linda Sherwood, Christopher J. Woolverton.

McGraw-Hill Higher Education.

 

Microbiologia ambientale ed elementi di ecologia microbica.

Paola Barbieri, Giuseppe Bestetti, Enrica Galli, Davide Zannoni.

Casa Editice Ambrosiana.

Bibliography

Slides (loaded after each lecture on e-learning moodle UNIPI Polo3).

 

Prescott's microbiology.

9th edition.

Joanne Wiley, Linda Sherwood, Christopher J. Woolverton.

McGraw-Hill Higher Education.

 

Microbiologia ambientale ed elementi di ecologia microbica.

Paola Barbieri, Giuseppe Bestetti, Enrica Galli, Davide Zannoni.

Casa Editice Ambrosiana.

Modalità d'esame

Esame orale.

Per gli studenti frequentanti il corso nell'AA 2020-2021, l'ammissione all'esame è subordinata allo svolgimento del progetto di analisi di dati con il programma QIIME2.

Durante l'esame orale lo studente dovrà dimostrare la sua conoscenza degli argomenti illustrati durante il corso, inclusi quelli trattati durante le attività di laboratorio, spiegandoli in modo esaustivo, chiaro, razionale e corretto. Lo studente dovrà essere in grado di presentare i diversi argomenti utilizzando una terminologia appropriata e con proprietà di linguaggio. Sarà inoltre valutata la capacità dello studente di discutere criticamente i concetti acquisiti durante il corso, insieme alla sua abilità nel mettere in relazione gli argomenti del corso con le sue conoscenze biologiche di base.

Assessment methods

Oral exam.

For students attending in the Academic year 2020-2021, admission to the exam is subordinated to the execution of the data analyses project on QIIME2.

During oral examination the student will demonstrate his/her knowledge of the topics explained during the course, included those of the laboratory activities. The topics will be explained exhaustively, clearly, rationally and accurately. The topics will be presented by the student with an appropriate terminology and with command of language. Critical discussion of concepts acquired during the course, together with ability of relating topics with basic biological knowledge will be also evaluated.

Altri riferimenti web

Registri delle lezioni e dei laboratori svolti per questo insegnamento (https://unimap.unipi.it/registri/registri.php?ri=011605&tmplt=principale.tpl&aa=2022).

e-learning moodle UNIPI Polo3.

Additional web pages

Register of the course with laboratories and lectures done in the past is available at the teacher’s web page on UNIMAP (https://unimap.unipi.it/registri/registri.php?ri=011605&tmplt=principale.tpl&aa=2022).

e-learning moodle UNIPI Polo3.

Note

NOTA PER ORARIO 2023/2024: a causa di problemi tecnici l'orario aggiornato è visibile solo dal link: https://unipi.prod.up.cineca.it/calendarioPubblico/linkCalendarioId=64e87cc25b8944003e39064e

In caso di necessità, per informazioni su orario e aule scrivere a Claudia Vannini (claudia.vannini@unipi.it).

 

Commissione d'esame.


Presidente: Claudia Vannini
Membri: Fabrizio Erra, Graziano Di Giuseppe

Presidente supplente: Graziano Di Giuseppe
Membri supplenti: Letizia Modeo, Monica Guerrini

Notes

Examination board.


President: Claudia Vannini
Members: Fabrizio Erra, Graziano Di Giuseppe

Substitute president: Graziano Di Giuseppe
Substitute members: Letizia Modeo, Monica Guerrini

Updated: 21/09/2023 16:43