CourseBIOLOGICAL SCIENCES
Code558EE
Credits6
PeriodSemester 1
LanguageItalian
| Modules | Area | Type | Hours | Teacher(s) | |
| MORFOMETRIA GEOMETRICA | BIO/08 | LEZIONI | 56 |
|
Al termine del corso:
- L* student* avrà acquisito conoscenze sui principali concetti e teorie della morfometria.
- L* student* avrà acquisito conoscenze in merito agli strumenti e alle metodologie per lo studio della variazione delle forme biologiche attraverso l’utilizzo di tecniche di morfometria tradizionale e di morfometria geometrica.
At the end of the course:
- Students will have acquired knowledge on the main concepts and theories of morphometrics.
- Students will have acquired knowledge about the tools and methodologies for studying biological shape variations through the use of traditional and geometric morphometric techniques.
Per accertare le conoscenze acquisite durante il corso, gli studenti analizzeranno un set di dati durante le sessioni di laboratorio.
La verifica delle conoscenze includerà la valutazione di un workbook digitale e di una prova orale.
To assess the knowledge acquired during the course, students will analyze a data set during laboratory sessions. Verification of knowledge will include evaluation of a written report and an oral exam.
Gli studenti saranno in grado di utilizzare in piena autonomia i principali software di morfometria geometrica. L* student* sarà in grado di processare un set di dati di morfometria tradizionale e di morfometria geometrica e sarà in grado di presentare i risultati dell'attività progettuale svolta nella forma di una relazione scritta.
Students will be able to independently use main geometric morphometric software. They will be able to process a data set for traditional and geometric morphometrics and be able to present the results of the project activity in a written report.
Durante le sessioni di laboratorio, l* student* svilupperà un piccolo progetto di ricerca a scelta utilizzando software open-access. I set di dati verranno forniti dal docente e riguarderanno temi antropologici, botanici o zoologici.
During laboratory sessions, students will develop a small research project using open-access software. Data sets will be provided by the teacher and will concern anthropological, botanical, or zoological subjects.
Gli studenti saranno in grado di gestire in autonomia uno studio di morfometria tradizionale e geometrica e di svolgere attività di raccolta e analisi dei dati biologici. Saranno inoltre in grado di esporre i risultati ottenuti in modo accurato e preciso.
Students will be able to independently manage a traditional and geometric morphometric study and carry out data collection and analysis of biological data. They will also be able to accurately and precisely present the obtained results.
Durante le sessioni di laboratorio, verrà valutato il grado di accuratezza e precisione delle attività svolte, oltre alla capacità di esporre i risultati ottenuti. Durante l'esame orale finale, verrà valutata la capacità di argomentazione sui temi trattati durante il corso
During laboratory sessions, the degree of accuracy and precision of the activities carried out will be evaluated, as well as the ability to present the obtained results accurately and precisely. During the final oral exam, the ability to argue the topics discussed during the course will be evaluated.
Il corso è composto da 16 lezioni frontali, 4 seminari e 8 sessioni di laboratorio. I seminari sono tenuti da esperti in morfometria geometrica. Durante le sessioni di laboratorio informatico, gli studenti utilizzeranno il proprio PC personale e potranno redigere la relazione scritta sia durante le sessioni di laboratorio, sia da casa. Il materiale didattico sarà disponibile nella cartella del corso di Morfometria Geometrica in Google Classroom.
The course consists of 16 lectures, 4 seminars and 8 laboratory sessions. The teaching material will be available in the Geometric Morphometrics folder on Google Classroom. The seminars will be given by experts in geometric morphometrics. During the computer laboratory sessions, students will use their own personal computers and will be able to write the report either during laboratory sessions or from home.
- Introduzione al corso e storia della morfometria
- Morfometria tradizionale
- Guida all’installazione dei software e presentazione dei casi studi (Laboratorio N.1)
- Interpretazione dei dati biologici
- Tutorial software PAST (Laboratorio N.2)
- Shape and size
- Introduzione alla morfometria geometrica
- Tutorial software TPS2dig (Laboratorio N.3)
- Tutorial software MorphoJ – livello 1 (Laboratorio N.4)
- Modelli tridimensionali e 3D imaging
- Tutorial software Slicer3D e MeshLab (Laboratorio N.5)
- Le variazioni di forma
- Storia della morfometria geometrica
- Modularità e integrazione
- Ontogenesi e allometria
- Tutorial software MorphoJ – livello 2 (Laboratorio N.6)
- Simmetria e asimmetria delle forme biologiche
- Filogenesi e morfometria
- Semilandmark in 2D (TPS2dig) (Laboratorio N.7)
- Supporto alla compilazione e revisione workbook (Laboratorio N.8)
- Introduction to the course and history of morphometrics
- Traditional morphometrics
- Guide to software installation and introduction of case studies (Lab N.1)
- Biological data interpretation
- Tutorial on PAST software (Lab N.2)
- Shape and size
- Introduction to geometric morphometrics
- Tutorial on TPS2dig software (Lab N.3)
- Tutorial on MorphoJ software - level 1 (Lab N.4)
- Three-dimensional models and 3D imaging
- Tutorial software Slicer3D and MeshLab (Lab. N.5)
- Shape and form variations
- History of geometric morphometrics
- Modularity and integration
- Ontogeny and allometry
- Tutorial on MorphoJ software - level 2 (Lab N.6)
- Symmetry and asymmetry of biological shapes
- Phylogeny and morphometrics
- Semilandmark in 2D (TPS2dig) (Lab N.7)
- Digital workbook review (Lab N.8)
Il materiale didattico sarà disponibile nella cartella del corso di Morfometria Geometrica in Google Classroom.
Link al corso in Google Classroom:
https://classroom.google.com/c/NjIxOTc2NTM1ODA4?cjc=gaok7vj
The teaching materials will be available in the Geometric Morphometrics on Google Classroom.
Link on Google Classroom:
https://classroom.google.com/c/NjIxOTc2NTM1ODA4?cjc=gaok7vj
La frequenza del corso è fortemente consigliata. Il materiale didattico e i tutorial dettagliati sui software utilizzati durante le sessioni di laboratorio saranno disponibili in Google Classroom.
Attendance for the course is strongly recommended. Teaching materials and detailed tutorials on the software used during laboratory sessions will be available on Google Classroom.
L'esame è composto da una prova scritta e una prova orale.
Prova scritta:
All’inizio del corso il docente fornirà un workbook digitale che l* student* compilerà durante le sessioni di laboratorio e da casa. La prova scritta una volta superata rimane valida per gli appelli successivi.
Prova orale:
Per accedere alla prova orale, gli studenti dovranno superare la prova scritta con un voto non inferiore a 18. La prova orale consiste in un colloquio tra il/la candidat* e il docente. La prova orale non è superata se il/la candidat* mostra ripetutamente l'incapacità di mettere in relazione parti del programma, oppure se non risponde correttamente a domande corrispondenti alle parti fondamentali del corso, corrispondenti agli argomenti elencati nel programma
The exam consists of a written test and an oral exam.
Written test: at the beginning of the course, the teacher will provide a digital workbook that the students will complete during laboratory sessions and from home. The written test, once passed, remains valid for subsequent exam sessions.
Oral exam: to take the oral exam, students must pass the written test with a grade not lower than 18. The oral exam consists of a conversation between the candidate and the teacher. The oral exam is not passed if the candidate repeatedly demonstrates an inability to relate parts of the program, or if they do not answer correctly to questions corresponding to the fundamental parts of the course related to the topics listed in the program.
https://unimap.unipi.it/registri/dettregistriNEW.php?re=10339832::::&ri=043670
Presidente: dott. Antonio Profico
Membri: prof. Damiano Marchi e prof. Giovanni Boschian
Presidente supplente: prof. Damiano Marchi
Membri supplenti: prof. Sergio Tofanelli e prof. Giulio Petroni
Chairman: dr Antonio Profico
Members: prof. Damiano Marchi and prof. Giovanni Boschian
Alternate Chairman: prof. Damiano Marchi
Alternate members: prof. Sergio Tofanelli and prof. Giulio Petroni