Scheda programma d'esame
METODI MOLECOLARI PER L'EPIDEMIOLOGIA DELLE MALATTIE INFETTIVE
MARCO VERANI
Anno accademico2023/24
CdSBIOLOGIA APPLICATA ALLA BIOMEDICINA
Codice357FF
CFU3
PeriodoSecondo semestre
LinguaItaliano

ModuliSettore/iTipoOreDocente/i
METODI MOLECOLARI PER L'EPIDEMIOLOGIA DELLE MALATTIE INFETTIVEMED/42LEZIONI24
MARCO VERANI unimap
Obiettivi di apprendimento
Learning outcomes
Conoscenze

Lo studente potrà acquisire le basi e le competenze per la caratterizzazione dei determinanti molecolari di salute e delle malattie infettive associando al disegno dello studio epidemiologico il contributo del laboratorio di biologia molecolare.

Knowledge

The student will acquire the basics and skills for the characterization of the health and infectious diseases molecular determinants by combining the design of the epidemiological study with the molecular biology laboratory contribution.

Modalità di verifica delle conoscenze

Durante l’esame orale sarà verificata la conoscenza della materia, con una particolare attenzione sulla capacità di sapersi orientare nel quadro dei diversi aspetti trattati durante il corso. Lo studente dovrà dimostrare le sue conoscenze attraverso una terminologia appropriata ed uno spirito critico.

Assessment criteria of knowledge

During the oral exam, the student’s knowledge of the subject will be verified, with particular attention to the ability to apply the different themes if the course. The student will have to demonstrate her/his knowledge using appropriate language and a critical understanding of the topics covered during the course.

Capacità

Lo studente sarà in grado di utilizzare le metodiche molecolari in campo epidemiologico affrontando problematiche legate a patologie infettive umane e alla contaminazione microbica ambientale.

 

 

Skills

The student will be able to use molecular methods in epidemiology for human infectious diseases and environmental contamination.

Modalità di verifica delle capacità

Durante l'esame orale lo studente sarà stimolato a risolvere problematiche epidemiologiche con le basi molecolari fornite da corso.

 

Assessment criteria of skills

During the oral exam students will be encouraged to solve epidemiological problems by the course provided molecular methods.

Comportamenti

Lo studente potrà acquisire competenze nell'ambito delle metodiche molecolari applicate all'organizzazione di un lavoro di monitoraggio ed interpretazione dati.

Behaviors

Students will acquire skills inmolecular methods applied to the monitoring and data interpretation.

Modalità di verifica dei comportamenti

L’acquisizione dei comportamenti verrà rilevata durante tutta la durata del corso. Nello specifico sarà valutata positivamente la partecipazione in aula e la proposta di temi di discussione.

Assessment criteria of behaviors

The demonstration of appropriate behaviour will be observed throughout the duration of the course. Specifically, the participation in the classroom and the proposal of discussion topics will be positively evaluated.

Prerequisiti (conoscenze iniziali)

Per una migliore comprensione degli argomenti del corso, è raccomandato che la formazione degli studenti includa elementi di igiene, igiene applicata e microbiologia.

Lo studente è invitato a verificare l'esistenza di eventuali propedeuticità consultando il Regolamento del Corso di studi relativo al proprio anno di immatricolazione. Un esame sostenuto in violazione delle regole di propedeuticità è nullo (Regolamento didattico d’Ateneo, art. 24, comma 3)

Prerequisites

For a better understanding of course topics, it is recommended that students' background will include Hygiene, Applied Hygiene and microbiology.

Students are invited to verify the existence of any prerequisites by consulting the Regulations of the Study Program relating to their year of enrolment. An exam taken in violation of the preparatory rules is void (University teaching regulations, art. 24, paragraph 3).

Indicazioni metodologiche

Il corso si svolgerà con lezioni frontali in italiano con ausilio di slides che saranno a disposizione sul sito elearning. Le comunicazioni con gli studenti saranno effettuate tramite ricevimento e posta elettronica.

Teaching methods

The course will be held by lectures with slides, shared on the elearning website. The communication with students will be possible through email.


Programma (contenuti dell'insegnamento)

 

Introduzione al Corso e definizioni

I metodi molecolari basati sulla discriminazione in base alle dimensioni e cariche: elettroforesi su gel, DGGE, SDS-PAGE, Citometria a flusso, Microfluidica, Spettrometria di massa

 I metodi molecolari basati sull’amplificazione genica: PCR, RAPD, Real Time PCR, Digital PCR, Sequenziamento genico.

I metodi basati sull'ibridazione e su reazioni antigene- anticorpo: Southern blot, Northern blot, FISH, microarrays, western blotting, ELISA.

L’epidemiologia molecolare delle malattie infettive: definizioni e applicazioni.

La prevenzione. Lo studio delle epidemie: definizione dell'esistenza di un epidemia, la correlazione epidemiologica, distinzione fra ceppi microbici con medesima clinica, identificazione della sorgente, valutazione della contaminazione diffusa, sorveglianza dei microrganismi resistenti, identificazione di nuovi patogeni. La sorveglianza epidemiologica ambientale (esempi e criticità). 

Lo studio della trasmissione (evidenze bibliografiche), Aumento delle conoscenze epidemiologiche delle malattie infettive, Identificazione di agenti infettivi non noti o non coltivabili, Identificazione dei geni di virulenza e patogenicità. 

Epidemiologia molecolare delle malattie nosocomiali: definizioni, vie di trasmissione e ruolo dell'ambiente. L'antibiotico resistenza. Criticità dell'applicazione delle metodiche molecolari in ambito epidemiologico.

 

Syllabus

Course Introduction and Definitions

The molecular methods based on the discrimination of the size and charge: gel electrophoresis, DGGE, SDS-PAGE, flow cytometry, Microfluidics, Mass Spectrometry

Molecular methods based on amplification of gene: PCR, RAPD, Real Time PCR, digital PCR, gene sequencing.

Methods based on hybridization antigen-antibody reactions: Southern blot, Northern blot, FISH, microarrays, western blotting, ELISA.

Molecular epidemiology of infectious diseases: definitions and applications,

Prevention. The study of epidemics: definition of an epidemic, the epidemiological correlation, distinction between microbial strains with the same clinic, identification of the source, evaluation of widespread contamination, surveillance of resistant microorganisms, identification of new pathogens. Environmental epidemiological surveillance (examples).

The study of transmission (bibliographic evidence), Increase in epidemiological knowledge of infectious diseases, Identification of unknown or non-culturable infectious agents, Identification of virulence and pathogenicity genes.

Molecular epidemiology of nosocomial diseases: definitions, transmission routes and role of the environment. The antibiotic resistance. Criticality of the application of molecular methods in the epidemiological field.

Bibliografia e materiale didattico

Molecular Tools and Infectious Disease Epidemiology – Foxman- Ed. Elsevier

Professione Igienista – Manuale dell’Igiene Ambientale e Territoriale – Gilli – Casa Editrice Ambrosiana

Articoli scientifici originali

Bibliography

Molecular Tools and Infectious Disease Epidemiology – Foxman- Ed. Elsevier

Professione Igienista – Manuale dell’Igiene Ambientale e Territoriale – Gilli – Casa Editrice Ambrosiana

Scientific Articles

 

Indicazioni per non frequentanti

Gli studenti non frequentanti sono pregati di contattare il docente per ulteriori informazioni sul materiale didattico e programma d'esame.

Non-attending students info

Non-attending students are requested to contact the teacher for further information about the teaching material and exam program.

Modalità d'esame

La prova di esame si svolge in modalità esclusivamente orale e consisterà in un seminario relativo ad un argomento a scelta dello studente fra quelli discussi nel corso presentato alla commissione di esame. Lo studente dovrà rivelare una visione chiara dell'argomento e una conoscenza precisa dei dettagli dimostrativi. 

 

Assessment methods

 

The examination will be exclusively in the form of an oral exam and it will consist on a seminar on a topic of the student's choice from a one's of the course. The student must demonstrate a clear vision of the topic and a precise knowledge of the technical details.

Note

Commissione di Esame

Presidente: Prof. Marco Verani
Membri: Prof.ssa Annalaura Carducci, Dott.ssa Ileana Federigi

Presidente supplente: Prof.ssa Annalaura Carducci
Membri supplenti:  Dott.ssa Alessandra Pagani (cultore), Dott. Nebiyu Tariku Atomsa (cultore)

Notes

Exam Commission

President: Prof. Marco Verani
Members: Prof.ssa Annalaura Carducci, Dott.ssa Ileana Federigi

President substituer Prof.ssa Annalaura Carducci
Members substituter:  Dott.ssa Alessandra Pagani, Dott. Nebiyu Tariku Atomsa

Ultimo aggiornamento 10/02/2024 14:21