CdSBIOLOGIA APPLICATA ALLA BIOMEDICINA
Codice357FF
CFU3
PeriodoSecondo semestre
LinguaItaliano
Moduli | Settore/i | Tipo | Ore | Docente/i | |
METODI MOLECOLARI PER L'EPIDEMIOLOGIA DELLE MALATTIE INFETTIVE | MED/42 | LEZIONI | 24 |
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Lo studente potrà acquisire le basi e le competenze per la caratterizzazione dei determinanti molecolari di salute e delle malattie infettive associando al disegno dello studio epidemiologico il contributo del laboratorio di biologia molecolare.
The student will acquire the basics and skills for the characterization of the health and infectious diseases molecular determinants by combining the design of the epidemiological study with the molecular biology laboratory contribution.
Durante l’esame orale sarà verificata la conoscenza della materia, con una particolare attenzione sulla capacità di sapersi orientare nel quadro dei diversi aspetti trattati durante il corso. Lo studente dovrà dimostrare le sue conoscenze attraverso una terminologia appropriata ed uno spirito critico.
During the oral exam, the student’s knowledge of the subject will be verified, with particular attention to the ability to apply the different themes if the course. The student will have to demonstrate her/his knowledge using appropriate language and a critical understanding of the topics covered during the course.
Lo studente sarà in grado di utilizzare le metodiche molecolari in campo epidemiologico affrontando problematiche legate a patologie infettive umane e alla contaminazione microbica ambientale.
The student will be able to use molecular methods in epidemiology for human infectious diseases and environmental contamination.
Durante l'esame orale lo studente sarà stimolato a risolvere problematiche epidemiologiche con le basi molecolari fornite da corso.
During the oral exam students will be encouraged to solve epidemiological problems by the course provided molecular methods.
Lo studente potrà acquisire competenze nell'ambito delle metodiche molecolari applicate all'organizzazione di un lavoro di monitoraggio ed interpretazione dati.
Students will acquire skills inmolecular methods applied to the monitoring and data interpretation.
L’acquisizione dei comportamenti verrà rilevata durante tutta la durata del corso. Nello specifico sarà valutata positivamente la partecipazione in aula e la proposta di temi di discussione.
The demonstration of appropriate behaviour will be observed throughout the duration of the course. Specifically, the participation in the classroom and the proposal of discussion topics will be positively evaluated.
Per una migliore comprensione degli argomenti del corso, è raccomandato che la formazione degli studenti includa elementi di igiene, igiene applicata e microbiologia.
Lo studente è invitato a verificare l'esistenza di eventuali propedeuticità consultando il Regolamento del Corso di studi relativo al proprio anno di immatricolazione. Un esame sostenuto in violazione delle regole di propedeuticità è nullo (Regolamento didattico d’Ateneo, art. 24, comma 3)
For a better understanding of course topics, it is recommended that students' background will include Hygiene, Applied Hygiene and microbiology.
Students are invited to verify the existence of any prerequisites by consulting the Regulations of the Study Program relating to their year of enrolment. An exam taken in violation of the preparatory rules is void (University teaching regulations, art. 24, paragraph 3).
Il corso si svolgerà con lezioni frontali in italiano con ausilio di slides che saranno a disposizione sul sito elearning. Le comunicazioni con gli studenti saranno effettuate tramite ricevimento e posta elettronica.
The course will be held by lectures with slides, shared on the elearning website. The communication with students will be possible through email.
Introduzione al Corso e definizioni
I metodi molecolari basati sulla discriminazione in base alle dimensioni e cariche: elettroforesi su gel, DGGE, SDS-PAGE, Citometria a flusso, Microfluidica, Spettrometria di massa
I metodi molecolari basati sull’amplificazione genica: PCR, RAPD, Real Time PCR, Digital PCR, Sequenziamento genico.
I metodi basati sull'ibridazione e su reazioni antigene- anticorpo: Southern blot, Northern blot, FISH, microarrays, western blotting, ELISA.
L’epidemiologia molecolare delle malattie infettive: definizioni e applicazioni.
La prevenzione. Lo studio delle epidemie: definizione dell'esistenza di un epidemia, la correlazione epidemiologica, distinzione fra ceppi microbici con medesima clinica, identificazione della sorgente, valutazione della contaminazione diffusa, sorveglianza dei microrganismi resistenti, identificazione di nuovi patogeni. La sorveglianza epidemiologica ambientale (esempi e criticità).
Lo studio della trasmissione (evidenze bibliografiche), Aumento delle conoscenze epidemiologiche delle malattie infettive, Identificazione di agenti infettivi non noti o non coltivabili, Identificazione dei geni di virulenza e patogenicità.
Epidemiologia molecolare delle malattie nosocomiali: definizioni, vie di trasmissione e ruolo dell'ambiente. L'antibiotico resistenza. Criticità dell'applicazione delle metodiche molecolari in ambito epidemiologico.
Course Introduction and Definitions
The molecular methods based on the discrimination of the size and charge: gel electrophoresis, DGGE, SDS-PAGE, flow cytometry, Microfluidics, Mass Spectrometry
Molecular methods based on amplification of gene: PCR, RAPD, Real Time PCR, digital PCR, gene sequencing.
Methods based on hybridization antigen-antibody reactions: Southern blot, Northern blot, FISH, microarrays, western blotting, ELISA.
Molecular epidemiology of infectious diseases: definitions and applications,
Prevention. The study of epidemics: definition of an epidemic, the epidemiological correlation, distinction between microbial strains with the same clinic, identification of the source, evaluation of widespread contamination, surveillance of resistant microorganisms, identification of new pathogens. Environmental epidemiological surveillance (examples).
The study of transmission (bibliographic evidence), Increase in epidemiological knowledge of infectious diseases, Identification of unknown or non-culturable infectious agents, Identification of virulence and pathogenicity genes.
Molecular epidemiology of nosocomial diseases: definitions, transmission routes and role of the environment. The antibiotic resistance. Criticality of the application of molecular methods in the epidemiological field.
Molecular Tools and Infectious Disease Epidemiology – Foxman- Ed. Elsevier
Professione Igienista – Manuale dell’Igiene Ambientale e Territoriale – Gilli – Casa Editrice Ambrosiana
Articoli scientifici originali
Molecular Tools and Infectious Disease Epidemiology – Foxman- Ed. Elsevier
Professione Igienista – Manuale dell’Igiene Ambientale e Territoriale – Gilli – Casa Editrice Ambrosiana
Scientific Articles
Gli studenti non frequentanti sono pregati di contattare il docente per ulteriori informazioni sul materiale didattico e programma d'esame.
Non-attending students are requested to contact the teacher for further information about the teaching material and exam program.
La prova di esame si svolge in modalità esclusivamente orale e consisterà in un seminario relativo ad un argomento a scelta dello studente fra quelli discussi nel corso presentato alla commissione di esame. Lo studente dovrà rivelare una visione chiara dell'argomento e una conoscenza precisa dei dettagli dimostrativi.
The examination will be exclusively in the form of an oral exam and it will consist on a seminar on a topic of the student's choice from a one's of the course. The student must demonstrate a clear vision of the topic and a precise knowledge of the technical details.
Commissione di Esame
Presidente: Prof. Marco Verani
Membri: Prof.ssa Annalaura Carducci, Dott.ssa Ileana Federigi
Presidente supplente: Prof.ssa Annalaura Carducci
Membri supplenti: Dott.ssa Alessandra Pagani (cultore), Dott. Nebiyu Tariku Atomsa (cultore)
Exam Commission
President: Prof. Marco Verani
Members: Prof.ssa Annalaura Carducci, Dott.ssa Ileana Federigi
President substituer Prof.ssa Annalaura Carducci
Members substituter: Dott.ssa Alessandra Pagani, Dott. Nebiyu Tariku Atomsa